143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0268 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0268  ribosomal protein L23  100 
 
 
94 aa  181  3e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  6.90365e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  39.33 
 
 
98 aa  63.9  6e-10  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 
104 aa  62  3e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 
98 aa  58.9  2e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
98 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  37.08 
 
 
98 aa  57  8e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
98 aa  56.6  1e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  34.83 
 
 
98 aa  56.2  1e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  35.96 
 
 
96 aa  56.2  1e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  40.43 
 
 
113 aa  55.8  2e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  34.83 
 
 
98 aa  54.7  4e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0428  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
116 aa  54.3  6e-07  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.91057e-11  decreased coverage  5.64548e-06 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
98 aa  53.5  9e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
98 aa  53.5  9e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  37.08 
 
 
98 aa  53.1  1e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0486  50S ribosomal protein L23  39.33 
 
 
116 aa  52.8  1e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  9.45976e-07  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  32.58 
 
 
111 aa  53.1  1e-06  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0491  50S ribosomal protein L23  39.33 
 
 
116 aa  52.8  1e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  3.10283e-09  hitchhiker  0.00323784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 
102 aa  52.8  2e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  35.96 
 
 
97 aa  52  2e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  37.08 
 
 
98 aa  52  3e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  34.83 
 
 
97 aa  51.2  5e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  32.58 
 
 
98 aa  51.2  5e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  34.83 
 
 
97 aa  51.2  5e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  34.83 
 
 
97 aa  50.4  8e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  34.83 
 
 
97 aa  50.4  8e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  35.96 
 
 
97 aa  50.1  1e-05  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.42276e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  35.96 
 
 
97 aa  50.1  1e-05  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.43862e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  34.48 
 
 
96 aa  50.1  1e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  34.83 
 
 
97 aa  50.1  1e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  33.71 
 
 
100 aa  50.1  1e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  34.83 
 
 
94 aa  49.7  1e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 
98 aa  48.9  2e-05  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  28.57 
 
 
97 aa  48.9  2e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.79883e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  37.5 
 
 
98 aa  48.5  3e-05  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  33.73 
 
 
104 aa  48.5  3e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  40.74 
 
 
111 aa  48.5  3e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0363  50S ribosomal protein L23  40.45 
 
 
98 aa  48.1  4e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.674139  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  32.58 
 
 
99 aa  48.1  4e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1718  50S ribosomal protein L23  40.45 
 
 
98 aa  48.1  4e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0786377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  32.58 
 
 
99 aa  47.8  5e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  32.58 
 
 
99 aa  47.8  6e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  30.34 
 
 
98 aa  47.8  6e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  31.46 
 
 
97 aa  47.4  7e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  32.58 
 
 
99 aa  47.4  7e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  35.23 
 
 
94 aa  47.4  8e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.16587e-06  hitchhiker  9.56309e-13 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  35.56 
 
 
99 aa  47.4  8e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  33.71 
 
 
103 aa  47  8e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  33.71 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_002978  WD0679  50S ribosomal protein L23  30.68 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0812265  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  33.33 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  32.95 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4546  50S ribosomal protein L23  35.23 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215144  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0610  50S ribosomal protein L23  32.89 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0628  ribosomal protein L23  35.23 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  2.67442e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  32.95 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.34151e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  31.82 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  34.09 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5077  50S ribosomal protein L23  35.23 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  5.3863e-08  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  30.34 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  32.95 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  32.58 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  31.82 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0150  50S ribosomal protein L23  27.59 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.25205e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  31.46 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  1.15816e-05 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  35.23 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1966  50S ribosomal protein L23  34.12 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  8.55171e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  37.5 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  32.95 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0201  50S ribosomal protein L23  27.16 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.18285e-09  hitchhiker  1.27878e-09 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0160  50S ribosomal protein L23  26.44 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.44621e-05  decreased coverage  4.12321e-05 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  32.18 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0233  50S ribosomal protein L23  27.16 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0322  50S ribosomal protein L23  29.89 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00637694  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0172  50S ribosomal protein L23  27.16 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.43767e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0202  50S ribosomal protein L23  27.16 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.51497e-07  unclonable  7.70372e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0198  50S ribosomal protein L23  27.16 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  7.95974e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3757  50S ribosomal protein L23  27.16 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.28479e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2532  50S ribosomal protein L23  39.33 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128178  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4168  50S ribosomal protein L23  27.16 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.63544e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4054  50S ribosomal protein L23  27.16 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.282e-06  unclonable  5.66696e-12 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0411  50S ribosomal protein L23  31.58 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.727367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0297  ribosomal L23 protein  34.48 
 
 
98 aa  43.5  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.30523e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  32.58 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0486  50S ribosomal protein L23  34.09 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438289  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  34.09 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  29.55 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0456  50S ribosomal protein L23  34.09 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0420406  unclonable  1.64588e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  25.93 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  9.57762e-07  unclonable  6.93674e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0196  50S ribosomal protein L23  27.16 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000848979  decreased coverage  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0201  50S ribosomal protein L23  27.16 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  6.98801e-06  unclonable  1.84888e-11 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0489  50S ribosomal protein L23  34.09 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  1.9112e-08  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  32.1 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  35.63 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  8.28313e-06  decreased coverage  1.12275e-05 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  34.94 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  31.82 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3907  50S ribosomal protein L23  31.82 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.104737  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  31.82 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  3.36824e-09 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>