More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0267 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0267  ribosomal protein L4  100 
 
 
214 aa  424  1e-118  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  3.35514e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0611  50S ribosomal protein L4  44.76 
 
 
205 aa  193  2e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.937443  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0410  50S ribosomal protein L4  43.81 
 
 
205 aa  189  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1945  50S ribosomal protein L4  48.84 
 
 
216 aa  184  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0680  50S ribosomal protein L4  44.76 
 
 
204 aa  177  8e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0323983  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2967  50S ribosomal protein L4  48.08 
 
 
204 aa  177  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.191884  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  47.96 
 
 
206 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 
206 aa  161  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0352  50S ribosomal protein L4  44.98 
 
 
206 aa  155  5e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  44.28 
 
 
206 aa  154  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  2.54915e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1365  50S ribosomal protein L4  44.9 
 
 
206 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65413  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  45.41 
 
 
206 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1546  50S ribosomal protein L4  43.88 
 
 
206 aa  152  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0362  50S ribosomal protein L4  44.72 
 
 
206 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  48.59 
 
 
207 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1717  50S ribosomal protein L4  44.72 
 
 
206 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1680  50S ribosomal protein L4  41.84 
 
 
206 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  hitchhiker  4.99421e-05 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2533  50S ribosomal protein L4  42.58 
 
 
206 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202589  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  47.46 
 
 
207 aa  147  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.23482e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2163  50S ribosomal protein L4  40.19 
 
 
206 aa  147  1e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3666  50S ribosomal protein L4  44.9 
 
 
206 aa  147  1e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2441  50S ribosomal protein L4  40.19 
 
 
206 aa  147  1e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2296  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 
206 aa  146  2e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3183  50S ribosomal protein L4  43.88 
 
 
206 aa  146  2e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  40.19 
 
 
206 aa  147  2e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5069  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 
206 aa  145  4e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.312873  normal  0.444752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0579  50S ribosomal protein L4  41.84 
 
 
206 aa  145  7e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0584  50S ribosomal protein L4  43.37 
 
 
206 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  41.5 
 
 
206 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2219  50S ribosomal protein L4  41.15 
 
 
206 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372251  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  46.82 
 
 
223 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  42.02 
 
 
207 aa  142  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  48.47 
 
 
207 aa  141  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.03712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0247  50S ribosomal protein L4  42.58 
 
 
205 aa  140  1e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.767965  normal  0.730186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  46.95 
 
 
207 aa  140  1e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.04823e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  46.11 
 
 
207 aa  140  2e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  46.11 
 
 
207 aa  140  2e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.00585e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0277  50S ribosomal protein L4  43.88 
 
 
205 aa  140  2e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187422  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  46.11 
 
 
207 aa  140  2e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.72324e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  46.11 
 
 
207 aa  140  2e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.90155e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  46.11 
 
 
207 aa  140  2e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.34057e-10  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  46.11 
 
 
207 aa  140  2e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  46.11 
 
 
207 aa  140  2e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.56275e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  46.11 
 
 
207 aa  140  2e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.36863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  46.11 
 
 
207 aa  140  2e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.63463e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  45.51 
 
 
207 aa  139  4e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  5.44936e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1232  50S ribosomal protein L4  40.82 
 
 
206 aa  138  5e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24642  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0760  50S ribosomal protein L4  44.02 
 
 
206 aa  138  5e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1195  50S ribosomal protein L4  40.82 
 
 
206 aa  138  5e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280242  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  42.35 
 
 
206 aa  138  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1355  50S ribosomal protein L4  39.29 
 
 
206 aa  138  8e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700981  normal  0.0533022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1431  50S ribosomal protein L4  40.87 
 
 
206 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112454  normal  0.0117604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1957  50S ribosomal protein L4  40.82 
 
 
206 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0667  50S ribosomal protein L4  42.54 
 
 
206 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  7.64856e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0699  50S ribosomal protein L4  42.54 
 
 
206 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  2.31924e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1333  50S ribosomal protein L4  41.35 
 
 
206 aa  136  3e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.177589 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  42.27 
 
 
207 aa  136  3e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1615  50S ribosomal protein L4  40.95 
 
 
212 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.140901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  41.76 
 
 
207 aa  135  6e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  3.92239e-05  decreased coverage  1.22182e-05 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  39.5 
 
 
215 aa  135  6e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  40 
 
 
206 aa  134  1e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.29639e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  38.83 
 
 
206 aa  133  2e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.05367e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  41.45 
 
 
207 aa  133  2e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  40.31 
 
 
206 aa  133  2e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  38.21 
 
 
216 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  40.96 
 
 
208 aa  132  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.99505e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1794  50S ribosomal protein L4  40.59 
 
 
211 aa  131  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130776  normal  0.0731355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  41.33 
 
 
206 aa  131  7e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  39.79 
 
 
206 aa  131  8e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  40.09 
 
 
215 aa  131  8e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  41.81 
 
 
206 aa  130  1e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.85593e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  41.94 
 
 
206 aa  129  2e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.69503e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  42.2 
 
 
221 aa  130  2e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  7.17748e-06 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  38.24 
 
 
207 aa  129  2e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  7.91532e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  39.9 
 
 
207 aa  130  2e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  44.51 
 
 
223 aa  130  2e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  37.56 
 
 
207 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.66858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  43.98 
 
 
209 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  42.35 
 
 
207 aa  129  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  44 
 
 
234 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  39.62 
 
 
216 aa  128  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  41.05 
 
 
208 aa  128  8e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.79055e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  38.62 
 
 
207 aa  127  9e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  38.05 
 
 
208 aa  127  1e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.69782e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  40.64 
 
 
208 aa  127  1e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.18286e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  38.81 
 
 
222 aa  127  1e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17150  LSU ribosomal protein L4P  42.05 
 
 
211 aa  126  2e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  38.78 
 
 
206 aa  127  2e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2686  ribosomal protein L4/L1e  42.86 
 
 
206 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751145 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  42.51 
 
 
207 aa  126  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.35339e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17340  Putative mitochondrial ribosomal protein L4  39.39 
 
 
224 aa  126  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000952824  normal  0.0986734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  42.17 
 
 
206 aa  125  4e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.20704e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  41.34 
 
 
217 aa  125  4e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  40 
 
 
223 aa  125  4e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2974  50S ribosomal protein L4P  42.86 
 
 
205 aa  125  4e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  37 
 
 
220 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.30014e-06  hitchhiker  3.1805e-13 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  40.4 
 
 
210 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  5.86581e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  39.18 
 
 
248 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  40.57 
 
 
234 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  41.54 
 
 
207 aa  125  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>