More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0266 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0266  ribosomal protein L3  100 
 
 		 210 aa  423  1e-117  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000000356629  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0276  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 279 aa  211  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1716  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0849831  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0361  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2534  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 239 aa  208  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.129465  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0698  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 246 aa  208  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000853628  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0666  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 246 aa  208  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700021  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0759  50S ribosomal protein L3  52.61 
 
 		 245 aa  207  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0409  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.214097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1956  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 238 aa  202  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00677731  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0681  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0111701  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1678  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0571094  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0612  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 231 aa  201  5e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2688  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1233  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1196  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2736  ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301212  normal  0.0821652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0246  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 		 239 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.982555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1795  50S ribosomal protein L3P  51.44 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.170696  normal  0.0358825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0986  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 228 aa  194  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191064  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1840  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 213 aa  191  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.053801  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1430  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 		 213 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544436  normal  0.0131541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1332  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1946  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1679  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123125  hitchhiker  0.0000530368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  48.08 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 		 257 aa  179  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1614  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 256 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2440  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2162  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2123  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1353  50S ribosomal protein L3  46.15 
 
 		 317 aa  175  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.685053  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0353  50S ribosomal protein L3  45.93 
 
 		 246 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1545  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0580  50S ribosomal protein L3  45.93 
 
 		 245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2218  50S ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 		 251 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0000666211  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1354  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 		 240 aa  171  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.03305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2295  50S ribosomal protein L3  47.17 
 
 		 241 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.208752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3667  50S ribosomal protein L3  48.11 
 
 		 241 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0858  ribosomal protein L3  44.13 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.451508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3448  50S ribosomal protein L3  46.7 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.925386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1364  50S ribosomal protein L3  47.17 
 
 		 247 aa  167  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.803937  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3184  50S ribosomal protein L3  46.7 
 
 		 241 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3999  50S ribosomal protein L3  45.71 
 
 		 226 aa  167  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5070  50S ribosomal protein L3  46.7 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.621506 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3443  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000129848  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10617  predicted protein  49.07 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290577  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0273  50S ribosomal protein L3  44.76 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000366458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0278  50S ribosomal protein L3  44.76 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000211938  decreased coverage  0.00000000129288 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0328  ribosomal protein L3  43 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3297  50S ribosomal protein L3  42.11 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000538385  hitchhiker  0.0000807722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2950  50S ribosomal protein L3  42.11 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000276942  decreased coverage  0.000000134206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 		 219 aa  164  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  43.75 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3019  50S ribosomal protein L3  43.06 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000216849  hitchhiker  0.0059333 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02690  ribosomal large subunit assembly and maintenance-related protein, putative  44.76 
 
 		 308 aa  162  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.881266  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  42.72 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3317  50S ribosomal protein L3  41.63 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000449005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  45.58 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0391  50S ribosomal protein L3  44.76 
 
 		 224 aa  161  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000698132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  43.69 
 
 		 216 aa  160  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2372  ribosomal protein L3  43.06 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3179  50S ribosomal protein L3  41.15 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000128128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  45.71 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0873  ribosomal protein L3  44.02 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  44.29 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0338  50S ribosomal protein L3  43.33 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274222  decreased coverage  0.000311926 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2169  50S ribosomal protein L3  42.58 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000300239  normal  0.384776 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0405  50S ribosomal protein L3P  41.23 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000000000324929  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  41.01 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  42.59 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  42.72 
 
 		 216 aa  158  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  42.38 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000479422  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  43.48 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  42.11 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  40.28 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  40.28 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  43.48 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  40.28 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  41.2 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  43 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  44.55 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4913  50S ribosomal protein L3  41.9 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00251627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  43.96 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000156273  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  43.96 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  43 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183333  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>