More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0265 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0265  ribosomal protein S10  100 
 
 
103 aa  211  2e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  5.99557e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  51.52 
 
 
102 aa  112  2e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  52.53 
 
 
102 aa  112  2e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  50.51 
 
 
103 aa  112  2e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  6.33059e-05  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  52.53 
 
 
102 aa  112  2e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  51.52 
 
 
102 aa  112  2e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  4.49756e-05 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  50.51 
 
 
102 aa  112  2e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  51.52 
 
 
102 aa  112  2e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  52.53 
 
 
102 aa  112  2e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  52.53 
 
 
102 aa  112  2e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  52.53 
 
 
102 aa  112  2e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  52.53 
 
 
102 aa  112  2e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  52.53 
 
 
102 aa  112  2e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  51.52 
 
 
102 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  51.52 
 
 
102 aa  111  4e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  51.52 
 
 
102 aa  111  4e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  51.52 
 
 
102 aa  111  4e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  50.51 
 
 
102 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  50.51 
 
 
102 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  50.51 
 
 
102 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  51.52 
 
 
102 aa  110  7e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  49.49 
 
 
102 aa  109  1e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  51.52 
 
 
102 aa  109  1e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4342  30S ribosomal protein S10  50.51 
 
 
101 aa  109  1e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0589307  normal  0.109776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2217  30S ribosomal protein S10  49.49 
 
 
102 aa  108  2e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507157  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0476  ribosomal protein S10  47.96 
 
 
108 aa  108  2e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  49.49 
 
 
102 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0227  ribosomal protein S10  51.52 
 
 
102 aa  107  4e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  51.02 
 
 
101 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  51.02 
 
 
101 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  51.02 
 
 
101 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1613  30S ribosomal protein S10  49.49 
 
 
102 aa  107  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  51.02 
 
 
101 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  48.48 
 
 
102 aa  107  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  48.48 
 
 
102 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5570  ribosomal protein S10  51.52 
 
 
101 aa  107  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.966668  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  49.49 
 
 
102 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  48.48 
 
 
102 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  48.48 
 
 
103 aa  107  7e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.64723e-06  decreased coverage  9.47215e-06 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  48.98 
 
 
105 aa  106  8e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  1.45478e-12  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0613  30S ribosomal protein S10  50.51 
 
 
108 aa  106  8e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  49.49 
 
 
104 aa  106  9e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0408  30S ribosomal protein S10  49.49 
 
 
108 aa  106  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0463032  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0305  ribosomal protein S10  50 
 
 
102 aa  106  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.33988  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1419  ribosomal protein S10  47.96 
 
 
117 aa  105  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0720  30S ribosomal protein S10  52.04 
 
 
105 aa  105  2e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0939005  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0697  ribosomal protein S10  48.48 
 
 
102 aa  104  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  5.81864e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0665  ribosomal protein S10  48.48 
 
 
102 aa  104  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  2.32715e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0078  30S ribosomal protein S10  47.96 
 
 
105 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0955651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  44.44 
 
 
102 aa  104  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  5.274e-06 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1248  30S ribosomal protein S10  45.45 
 
 
103 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2819  30S ribosomal protein S10  44.44 
 
 
103 aa  103  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  48.48 
 
 
102 aa  103  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1354  30S ribosomal protein S10  44.44 
 
 
103 aa  103  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.546745  normal  0.0408576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2775  30S ribosomal protein S10  48.98 
 
 
102 aa  103  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0390875  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0755  30S ribosomal protein S10  47.47 
 
 
103 aa  103  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  5.08535e-12  normal  0.0162488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  48.96 
 
 
102 aa  103  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  44.44 
 
 
102 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  4.86821e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  44.44 
 
 
102 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0473  30S ribosomal protein S10  47.47 
 
 
102 aa  102  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  1.56934e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  43 
 
 
103 aa  102  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_416  ribosomal protein S10  47.47 
 
 
102 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  5.74411e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1766  30S ribosomal protein S10  46.94 
 
 
105 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  5.57802e-06  normal  0.938375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  47.47 
 
 
106 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3163  30S ribosomal protein S10  47.47 
 
 
101 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.547346 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  44 
 
 
103 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  1.33875e-06  hitchhiker  7.22255e-07 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  49.49 
 
 
102 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.38297e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3025  30S ribosomal protein S10  44.44 
 
 
102 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.544765  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0659  30S ribosomal protein S10  45.92 
 
 
105 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.22107e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0766  30S ribosomal protein S10  45.92 
 
 
102 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000754172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0598  ribosomal protein S10  47.47 
 
 
101 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945265  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  44 
 
 
104 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  4.4729e-05  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2258  30S ribosomal protein S10  46.94 
 
 
105 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  3.23057e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  44 
 
 
103 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  2.31204e-05  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  46.46 
 
 
103 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  5.21962e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  48.48 
 
 
102 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0450  30S ribosomal protein S10  46.46 
 
 
102 aa  101  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.51072e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0841  ribosomal protein S10  46.46 
 
 
102 aa  101  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1186  30S ribosomal protein S10  43.43 
 
 
102 aa  101  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.376062  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1715  30S ribosomal protein S10  47.42 
 
 
102 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0360  30S ribosomal protein S10  47.42 
 
 
102 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2535  30S ribosomal protein S10  47.42 
 
 
102 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112296  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  46 
 
 
104 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0582  30S ribosomal protein S10  46.46 
 
 
103 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  43 
 
 
103 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  1.56586e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  43 
 
 
103 aa  100  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  43 
 
 
103 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  1.27009e-05  decreased coverage  9.26134e-10 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05710  30S ribosomal protein S10  47.47 
 
 
101 aa  100  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.751469  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0758  30S ribosomal protein S10  45.45 
 
 
102 aa  100  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389687  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  47.47 
 
 
102 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0124  30S ribosomal protein S10  46.94 
 
 
101 aa  100  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  46.94 
 
 
123 aa  100  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  8.99576e-06 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  43 
 
 
103 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  7.05562e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  47.47 
 
 
102 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.58853e-05  hitchhiker  3.28358e-14 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  47.47 
 
 
102 aa  100  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.05972e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  43.43 
 
 
102 aa  100  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.8248e-09  unclonable  9.40306e-08 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0980  ribosomal protein S10  46.94 
 
 
106 aa  100  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.604539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  47.47 
 
 
102 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1855  30S ribosomal protein S10  43.43 
 
 
115 aa  100  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000106721  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0336  30S ribosomal protein S10  43.43 
 
 
110 aa  100  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.89298e-12  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>