94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0198 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0198  putative transporter  100 
 
 
382 aa  757  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  5.51361e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  33.52 
 
 
381 aa  197  3e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  25.92 
 
 
399 aa  109  9e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  25.64 
 
 
393 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  24.87 
 
 
400 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  23.97 
 
 
391 aa  99.8  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  26.54 
 
 
400 aa  97.4  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  28.47 
 
 
401 aa  96.3  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  1.88211e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  25.65 
 
 
392 aa  94  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  24.2 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  5.79538e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  24.86 
 
 
401 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  25.5 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  23.5 
 
 
413 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  25.8 
 
 
432 aa  83.6  5e-15  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  23.14 
 
 
404 aa  77.4  4e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  6.02347e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  22.32 
 
 
397 aa  77  6e-13  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  1.70025e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  22.19 
 
 
367 aa  74.7  2e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  8.17553e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  25.89 
 
 
433 aa  72  2e-11  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  24.35 
 
 
408 aa  71.6  2e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.35647e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  31.61 
 
 
412 aa  67.4  4e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.98283e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.95 
 
 
387 aa  67  6e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.95 
 
 
387 aa  66.6  6e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  8.29053e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  22.66 
 
 
400 aa  65.9  1e-09  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.31541e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5008  sodium:dicarboxylate symporter  28.24 
 
 
405 aa  63.9  5e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5450  proton/glutamate symporter family protein  27.65 
 
 
405 aa  61.2  3e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5337  putative proton/glutamate symporter family protein  27.65 
 
 
405 aa  60.8  3e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5327  proton/glutamate symporter family protein, putative  27.65 
 
 
405 aa  61.2  3e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5065  proton/glutamate symporter family protein  27.65 
 
 
405 aa  61.2  3e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5384  putative proton/glutamate symporter family protein  27.65 
 
 
405 aa  61.2  3e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4897  proton/sodium-glutamate symport protein  27.65 
 
 
405 aa  61.2  3e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5622  putative proton/glutamate symporter family protein  27.65 
 
 
405 aa  61.2  3e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.91019e-12 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4910  proton/sodium-glutamate symport protein  27.65 
 
 
405 aa  61.2  3e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0263  sodium:dicarboxylate symporter  28.66 
 
 
411 aa  59.7  9e-08  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.17938e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5306  putative proton/glutamate symporter family protein  27.06 
 
 
405 aa  57.8  3e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37948e-15 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3757  sodium:dicarboxylate symporter  27.65 
 
 
405 aa  57  5e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0155  sodium:dicarboxylate symporter  25.15 
 
 
412 aa  55.8  1e-06  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0546  sodium:dicarboxylate symporter  24.28 
 
 
411 aa  52  2e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  31.07 
 
 
417 aa  51.2  3e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  27.31 
 
 
444 aa  50.1  6e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  25.9 
 
 
432 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  24.1 
 
 
442 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  24.1 
 
 
442 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  24.1 
 
 
442 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  27.03 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  29.66 
 
 
437 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  26.58 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  27.04 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  27.04 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.81335e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  26.58 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  27.04 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.11717e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  27.04 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  6.38682e-09  decreased coverage  1.34337e-12 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  25.17 
 
 
423 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3989  sodium:dicarboxylate symporter  25.34 
 
 
420 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  24.72 
 
 
433 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  25.28 
 
 
443 aa  47  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  26.89 
 
 
409 aa  47  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  2.67322e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3956  sodium:dicarboxylate symporter  26.71 
 
 
413 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.712566  normal  0.290558 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  25.17 
 
 
423 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  24.12 
 
 
442 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  25.17 
 
 
423 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  25.17 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  25.17 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  25.17 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  25.17 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  25.71 
 
 
422 aa  46.2  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  28.4 
 
 
481 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  25.21 
 
 
410 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  6.77504e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  25.17 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  26.25 
 
 
441 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  24.71 
 
 
439 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  25.17 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  26.42 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.06758e-55 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  24.49 
 
 
413 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  26.42 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.88738e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  26.42 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.73308e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  26.99 
 
 
435 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  28.06 
 
 
440 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1341  proton/glutamate symporter protein, C-terminus  26.42 
 
 
238 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.40093e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  28.06 
 
 
440 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  26.8 
 
 
402 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  2.75384e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  28.06 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  25.79 
 
 
423 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  3.96651e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2957  sodium:dicarboxylate symporter  27.89 
 
 
406 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0772221  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  25.32 
 
 
424 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.59183e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  29.41 
 
 
409 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  24.89 
 
 
457 aa  43.5  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  5.38008e-08  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  26.17 
 
 
437 aa  43.5  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  26.32 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  4.24647e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  25.79 
 
 
409 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  27.34 
 
 
449 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  26.09 
 
 
457 aa  43.1  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  25.16 
 
 
422 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  26.09 
 
 
457 aa  42.7  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  26.42 
 
 
425 aa  42.7  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>