More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0067 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0067  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 439 aa  890    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.188301  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  63.15 
 
 		 421 aa  542  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  61.5 
 
 		 418 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  62.44 
 
 		 421 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  62.68 
 
 		 421 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  62.21 
 
 		 421 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  62.21 
 
 		 421 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  61.97 
 
 		 421 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  63.15 
 
 		 421 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  59.62 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2835  transcription termination factor Rho  60.66 
 
 		 418 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  62.56 
 
 		 421 aa  531  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  62.21 
 
 		 421 aa  532  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2532  transcription termination factor Rho  63.7 
 
 		 422 aa  531  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  63.27 
 
 		 421 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  61.34 
 
 		 429 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  62.21 
 
 		 422 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  61.97 
 
 		 422 aa  534  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  61.5 
 
 		 436 aa  533  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  62.91 
 
 		 421 aa  531  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  62.44 
 
 		 421 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  62.41 
 
 		 418 aa  528  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1968  transcription termination factor Rho  59.95 
 
 		 435 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2845  transcription termination factor Rho  60.66 
 
 		 418 aa  528  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  0.0341841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  61.4 
 
 		 421 aa  530  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  62.76 
 
 		 422 aa  528  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  60.74 
 
 		 436 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  61.5 
 
 		 447 aa  525  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  60.97 
 
 		 436 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  59.02 
 
 		 418 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  61.59 
 
 		 428 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1842  transcription termination factor Rho  60.8 
 
 		 447 aa  518  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.660399 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  59.91 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1563  transcription termination factor Rho  60.8 
 
 		 506 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  58.31 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2863  transcription termination factor Rho  60.14 
 
 		 423 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  58.78 
 
 		 437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  59.02 
 
 		 421 aa  516  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0009  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 		 421 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000017892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  57.61 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2892  transcription termination factor Rho  59.86 
 
 		 422 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0137  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 		 476 aa  513  1e-144  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0803  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 		 469 aa  512  1e-144  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0631326  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1231  transcription termination factor Rho  59.86 
 
 		 422 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 415 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0200  transcription termination factor Rho  59.48 
 
 		 422 aa  511  1e-144  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.18497  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0994  transcription termination factor Rho  59.48 
 
 		 422 aa  511  1e-144  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 415 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0002  transcription termination factor Rho  60.14 
 
 		 434 aa  514  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303251  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1123  transcription termination factor Rho  57.65 
 
 		 420 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117933  normal  0.145069 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2668  transcription termination factor Rho  59.62 
 
 		 422 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.169241  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2210  transcription termination factor Rho  56.71 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1282  transcription termination factor Rho  56.91 
 
 		 430 aa  509  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0183251  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0042  transcription termination factor Rho  56.71 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133554  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1365  transcription termination factor Rho  56.71 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0123945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1855  transcription termination factor Rho  56.71 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  57.61 
 
 		 415 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2375  transcription termination factor Rho  56.71 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  58.78 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  55.99 
 
 		 503 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2248  transcription termination factor Rho  56.71 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.336797  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1126  transcription termination factor Rho  56.71 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722702  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  57.74 
 
 		 449 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  58.29 
 
 		 419 aa  511  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  57.04 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1031  transcription termination factor Rho  57.65 
 
 		 420 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0464905  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3453  transcription termination factor Rho  59.2 
 
 		 423 aa  507  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5019  transcription termination factor Rho  58.28 
 
 		 473 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000339489  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1187  transcription termination factor Rho  57.65 
 
 		 420 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.481707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  56.47 
 
 		 420 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  58.18 
 
 		 419 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  58.18 
 
 		 419 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  57.61 
 
 		 418 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  57.71 
 
 		 419 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5130  transcription termination factor Rho  56.47 
 
 		 420 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923516  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  56.71 
 
 		 420 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  57.71 
 
 		 419 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6250  transcription termination factor Rho  56.47 
 
 		 420 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1444  transcription termination factor Rho  56.47 
 
 		 420 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440911  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  56.47 
 
 		 420 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1767  transcription termination factor Rho  56.47 
 
 		 420 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  57.71 
 
 		 419 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1829  transcription termination factor Rho  56.47 
 
 		 420 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156095  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  58.18 
 
 		 416 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3189  transcription termination factor Rho  59 
 
 		 422 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0152106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  57.48 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  57.48 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0795  transcription termination factor Rho  58.81 
 
 		 435 aa  503  1e-141  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.292251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  57.48 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  57.48 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2998  transcription termination factor Rho  58.06 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0194587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  57.61 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  57.61 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 437 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  58.22 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  57.61 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  57.61 
 
 		 418 aa  501  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  57.61 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  57.85 
 
 		 419 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>