162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0065 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0065  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.595009  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  28.33 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  24.82 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  28.09 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  28.46 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  25.91 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  27.5 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  28.57 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  24.92 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  23.1 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  23.89 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.88 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  24.02 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.14 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  25.39 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  24.66 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  25.67 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.1 
 
 
314 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  28.42 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  25.67 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  26.42 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  26.32 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.89 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  25.97 
 
 
309 aa  62.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  24.57 
 
 
317 aa  62.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  22.7 
 
 
309 aa  62.4  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  22.08 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  22.54 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  28.46 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.53 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001435  putative transporter DME family  28.93 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100251  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  26.15 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  25.21 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  26.05 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  30 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  25.53 
 
 
297 aa  59.7  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  25.35 
 
 
311 aa  59.7  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  24.15 
 
 
274 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  27.2 
 
 
299 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  25.44 
 
 
312 aa  58.9  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  24.32 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  23.15 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  24.66 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  24.66 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  24.57 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  25.45 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  23.39 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  24 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  23.33 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  27.48 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  26.41 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  26.19 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  24.78 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  20 
 
 
301 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  26.19 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  25.08 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  24.06 
 
 
294 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  26.92 
 
 
313 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  25.42 
 
 
295 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  26.82 
 
 
323 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  25.2 
 
 
317 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  27.42 
 
 
292 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  26.85 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  24.29 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  24.44 
 
 
342 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  23.55 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  23.47 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  24.29 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  21.91 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  24.87 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  29.8 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  21.25 
 
 
285 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  23.04 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  21.4 
 
 
292 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.84 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  23.74 
 
 
320 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  26.21 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  28.07 
 
 
309 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  25.38 
 
 
288 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  23.53 
 
 
281 aa  52.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  27.38 
 
 
297 aa  52.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  31.76 
 
 
297 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  23.1 
 
 
317 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  29.14 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  27.43 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  29.14 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  23.93 
 
 
317 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  24.88 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  25.18 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  26.11 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.36 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1038  hypothetical protein  24.03 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  24.23 
 
 
324 aa  49.7  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2502  hypothetical protein  24.45 
 
 
285 aa  49.3  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06569  hypothetical protein  23.08 
 
 
311 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>