More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0060 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0060  ribosomal protein L9  100 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.356425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 202 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 195 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 194 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  40 
 
 		 201 aa  103  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  34.9 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 191 aa  100  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 199 aa  100  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  38.73 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2988  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 194 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 197 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 209 aa  98.6  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2415  50S ribosomal protein L9  37.91 
 
 		 202 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 147 aa  97.4  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2461  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 196 aa  97.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 179 aa  97.1  8e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  33.77 
 
 		 149 aa  97.1  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1694  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 202 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0817246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2293  50S ribosomal protein L9  39.71 
 
 		 198 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 189 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 211 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  37.06 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 189 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 189 aa  95.5  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  38.03 
 
 		 148 aa  95.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 192 aa  94.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 189 aa  94.4  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 147 aa  93.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0783  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 184 aa  93.2  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 209 aa  93.6  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  33.09 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 190 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 204 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1902  50S ribosomal protein L9  40.3 
 
 		 210 aa  92.8  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  34.03 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 189 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  38 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1436  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  38.46 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  36.11 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  38.35 
 
 		 189 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 190 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 190 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 194 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  40 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  38.35 
 
 		 189 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  33.1 
 
 		 188 aa  89  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  36.84 
 
 		 195 aa  88.6  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  35.67 
 
 		 196 aa  87  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 150 aa  87  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  35.62 
 
 		 149 aa  87  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  36.62 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 148 aa  87  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  34.67 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  32.41 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  34.9 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0418  ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1059  LSU ribosomal protein L9P / transcriptional regulator GntR family protein  40 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  33.77 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  36.57 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 148 aa  84.7  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 149 aa  84.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  35.04 
 
 		 149 aa  84.7  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 149 aa  84.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 149 aa  84.3  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  32 
 
 		 149 aa  84.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0310  50S ribosomal protein L9  37.76 
 
 		 208 aa  84.3  6e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  33.1 
 
 		 148 aa  84  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0891  50S ribosomal protein L9P  34.25 
 
 		 148 aa  84  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  34.03 
 
 		 159 aa  84  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>