135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0055 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0055  putative osmotically inducible protein  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0335  putative osmotically inducible protein  40.51 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.161455  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0671  transport-associated domain-containing protein  41.38 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.927155  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0321  hypothetical protein  40.51 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  36.81 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3691  transport-associated protein  29.71 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3015  transport-associated  38.15 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  29.02 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  29.76 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  29.76 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  29.76 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  29.76 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  29.76 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3875  transport-associated  30.59 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  32.81 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  31.16 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  31.11 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  29.8 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  31.13 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  29.8 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  27.92 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  29.14 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  31.94 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  29.14 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  29.14 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  29.14 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  29.14 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  29.14 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4816  transport-associated  31.79 
 
 		 258 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  28.49 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  25.67 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  28.49 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  28.49 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  28.49 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  28.49 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  30.16 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  29.14 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  27.37 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  25.27 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  30.49 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  26.82 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  26.26 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  26.26 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  29.26 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0632  transport-associated  28.82 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0273  transport-associated  29.24 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  26.26 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0110  putative lipoprotein  27.17 
 
 		 189 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.319547  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  24.73 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  26.26 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  26.26 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  24.73 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  26.26 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  26.26 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  30.7 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  30.7 
 
 		 190 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3428  transport-associated  27.6 
 
 		 284 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  29.08 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  28.72 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1637  transport-associated  27.33 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0588013 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  27.81 
 
 		 307 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  30.14 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  30.16 
 
 		 181 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  28.91 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4402  transport-associated  28.72 
 
 		 192 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  30.37 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2657  putative lipoprotein  24.43 
 
 		 195 aa  52.4  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  29.73 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  28.72 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  28 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  27.92 
 
 		 190 aa  52  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  27.81 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  30.14 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  30.14 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  30.34 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  28.12 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  30.14 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0737  hypothetical protein  29.44 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131598  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  27.78 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  26.47 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0408  transport-associated  24.19 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3263  transport-associated protein  26.78 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369629  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  25.5 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2939  transport-associated  30.09 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  29.2 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  28.83 
 
 		 266 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  28.83 
 
 		 266 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  26.49 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  28.83 
 
 		 266 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  28.83 
 
 		 256 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  28.83 
 
 		 266 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  28.83 
 
 		 266 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  28.83 
 
 		 256 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  29.2 
 
 		 184 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4687  transport-associated protein  28.03 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.314355  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  28.1 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0366  transport-associated, putative  26.49 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0416  transport-associated  23.66 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0908  transport-associated  28.32 
 
 		 177 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  33.06 
 
 		 628 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>