231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0050 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0050  putative membrane proetin  100 
 
 		 251 aa  499  1e-140  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0009  hypothetical protein  53.85 
 
 		 233 aa  259  4e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.0000179437  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0937  hypothetical protein  52.56 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419647  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6013  protein of unknown function UPF0005  52.94 
 
 		 236 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713321 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7161  protein of unknown function UPF0005  52.94 
 
 		 236 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147509  normal  0.897358 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6220  hypothetical protein  49.17 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4550  hypothetical protein  51.3 
 
 		 236 aa  238  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  52.73 
 
 		 236 aa  232  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  51.29 
 
 		 252 aa  225  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0950  hypothetical protein  50.44 
 
 		 240 aa  222  4.9999999999999996e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.816971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  48.66 
 
 		 245 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2225  protein of unknown function UPF0005  46.98 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0352825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  46.53 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2543  protein of unknown function UPF0005  46.55 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.0807809 
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  48.66 
 
 		 245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  48.66 
 
 		 245 aa  211  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1019  hypothetical protein  45.69 
 
 		 256 aa  211  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.219255  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  45.06 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2043  hypothetical protein  46.77 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28558  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  45.31 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3353  hypothetical protein  46.49 
 
 		 248 aa  208  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3093  integral membrane protein  46.35 
 
 		 237 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.718082  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  42.97 
 
 		 256 aa  208  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3820  hypothetical protein  46.35 
 
 		 237 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3673  hypothetical protein  49.78 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.915645 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  48.87 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0671  hypothetical protein  44.35 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  decreased coverage  0.00362929 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  44.53 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  43.93 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  43.93 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1779  protein of unknown function UPF0005  44.08 
 
 		 274 aa  198  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1143  hypothetical protein  45.65 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1913  hypothetical protein  43.03 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.841584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1912  protein of unknown function UPF0005  45.8 
 
 		 261 aa  194  9e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0849  hypothetical protein  46.67 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0413  hypothetical protein  45.9 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5468  hypothetical protein  43.27 
 
 		 274 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  42.68 
 
 		 256 aa  191  9e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0100  hypothetical protein  45.61 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0386  putative transport protein  44.26 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0287  hypothetical protein  43.03 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0137467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0529  hypothetical protein  43.03 
 
 		 263 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  45.41 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0551  hypothetical protein  44.05 
 
 		 271 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0813  hypothetical protein  46.36 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0875239  hitchhiker  0.00101032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0200  hypothetical protein  41.67 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2268  hypothetical protein  44.26 
 
 		 294 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476385 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3668  hypothetical protein  41.56 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16725  hitchhiker  0.0000130091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  41.35 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  41.35 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0260  protein of unknown function UPF0005  41.7 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0529527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  40.93 
 
 		 236 aa  175  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0828  hypothetical protein  46.35 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  38.25 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0129  hypothetical protein  48.42 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.576127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3558  hypothetical protein  39.27 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1325  hypothetical protein  39.66 
 
 		 236 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  41.89 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0809  hypothetical protein  40.79 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00257878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1517  hypothetical protein  38.98 
 
 		 235 aa  168  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00753  predicted inner membrane protein  41.55 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2856  protein of unknown function UPF0005  41.55 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00770  hypothetical protein  41.55 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2566  hypothetical protein  41.55 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0849  hypothetical protein  41.55 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2857  hypothetical protein  41.55 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0840  hypothetical protein  41.55 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  38.98 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1278  hypothetical protein  37.87 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0795  hypothetical protein  41.7 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  44.44 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  41.3 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0934  hypothetical protein  41.1 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0956  inner membrane protein YbhL  37.87 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0901  inner membrane protein YbhL  37.87 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0870  membrane protein  37.87 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0842  inner membrane protein YbhL  37.87 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0912  hypothetical protein  43.87 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5385  hypothetical protein  39.48 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  41.28 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  41.2 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0933  hypothetical protein  38.91 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  42.99 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0430200000000002e-29 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  40 
 
 		 235 aa  155  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  37.55 
 
 		 236 aa  155  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  38.67 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2141  hypothetical protein  41.85 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000126118  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3162  protein of unknown function UPF0005  39.44 
 
 		 234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  40.28 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1228  hypothetical protein  34.69 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.181817  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0302  hypothetical protein  40.2 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4993  hypothetical protein  37.72 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  34.47 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1437  protein of unknown function UPF0005  37.32 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3983  hypothetical protein  41.47 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4095  protein of unknown function UPF0005  41.01 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4126  protein of unknown function UPF0005  41.01 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3782  protein of unknown function UPF0005  36.73 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2972  hypothetical protein  35.32 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416031  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  35.14 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>