More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0049 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0049  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
570 aa  1163    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0402  arginyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
568 aa  464  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0498  arginyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
576 aa  440  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0537  arginyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
576 aa  436  1e-121  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3194  arginyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 
592 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2750  arginyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
597 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292272  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3022  arginyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
583 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184997  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1728  arginyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
581 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  0.529501 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4245  arginyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
586 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2795  arginyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
597 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0417013  normal  0.0873054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2508  arginyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
597 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1807  arginyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
597 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1507  arginyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
575 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164187  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4423  arginyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
598 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.69944  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1588  arginyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
580 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.175533 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2943  arginyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 
583 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201497  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1758  arginyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
597 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0903  arginyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
580 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0902  arginyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
580 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.09451  normal  0.0464581 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0749  arginyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
585 aa  396  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0173421  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3935  arginyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
576 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2351  arginyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
585 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1482  arginyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
585 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747678  normal  0.431119 
 
 
-
 
NC_004310  BR0877  arginyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 
585 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3396  arginyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
585 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111317  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2767  arginyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
583 aa  395  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0538697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1680  arginyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
585 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21246  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1158  arginyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
585 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3705  arginyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
585 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.893232 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0868  arginyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
585 aa  392  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2675  arginyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
585 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135814  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1138  arginyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
575 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3587  arginyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
594 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170278  normal  0.919979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2710  arginyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
590 aa  389  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0495  arginyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
598 aa  385  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1813  arginyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
585 aa  385  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2178  arginyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
590 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1779  arginyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
592 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0946273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2480  arginyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
586 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299544  normal  0.119664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0112  arginyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
580 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 
575 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1870  arginyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
581 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116057  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0949  arginyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
596 aa  363  6e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.53802  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1089  arginyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
582 aa  358  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0443  arginyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
597 aa  356  5.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
554 aa  347  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
554 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  36 
 
 
559 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 
598 aa  333  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 
598 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 
586 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
553 aa  327  5e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 
550 aa  324  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 
551 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 
551 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
553 aa  319  7e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
557 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 
605 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1524  arginyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 
598 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 
556 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
551 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
556 aa  318  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5548  arginyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 
550 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.0339829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
554 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
559 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
551 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
556 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
556 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
556 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
556 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
556 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
556 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
556 aa  312  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
556 aa  312  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 
598 aa  311  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 
587 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 
556 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
561 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
551 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
560 aa  306  9.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 
586 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 
556 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
559 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
564 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
588 aa  300  5e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
553 aa  299  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11319  arginyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 
550 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3653  arginyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 
554 aa  297  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1228  arginyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
550 aa  297  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
556 aa  296  5e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 
592 aa  296  7e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
564 aa  296  7e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 
584 aa  295  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 
553 aa  296  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 
553 aa  296  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
550 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
551 aa  294  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 
579 aa  294  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
556 aa  294  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>