More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0016 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0016  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
402 aa  835    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.64 
 
 
396 aa  396  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.42206  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0735  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.92 
 
 
404 aa  392  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0662532  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0577  queuine/other tRNA- ribosyl transferase  52.03 
 
 
396 aa  390  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0321694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1658  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.9 
 
 
405 aa  316  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193813 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0129  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.97 
 
 
404 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1302  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.31 
 
 
400 aa  312  7.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3728  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.42 
 
 
403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4524  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.75 
 
 
408 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.01 
 
 
373 aa  299  7e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.42 
 
 
372 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.83 
 
 
388 aa  296  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.14 
 
 
370 aa  296  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.69 
 
 
375 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42734  predicted protein  39.95 
 
 
437 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0479124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.89 
 
 
370 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.21 
 
 
380 aa  288  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.89 
 
 
394 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.21 
 
 
392 aa  286  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.95 
 
 
380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.31 
 
 
387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.18 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.98 
 
 
381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.28 
 
 
380 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.53 
 
 
384 aa  278  9e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.92 
 
 
379 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
383 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.02 
 
 
379 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.71 
 
 
374 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.76 
 
 
379 aa  276  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.76 
 
 
379 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.76 
 
 
379 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.76 
 
 
379 aa  276  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.76 
 
 
379 aa  276  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.76 
 
 
379 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.76 
 
 
379 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.4 
 
 
380 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.44 
 
 
385 aa  275  8e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.5 
 
 
379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.46 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.5 
 
 
379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.5 
 
 
379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0465  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.36 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.7 
 
 
369 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24792  predicted protein  38.73 
 
 
513 aa  273  5.000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.379342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.13 
 
 
357 aa  272  6e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.84 
 
 
384 aa  271  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.73 
 
 
379 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.73 
 
 
379 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.33 
 
 
373 aa  271  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.98 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3438  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.99 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000261691  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.33 
 
 
379 aa  270  4e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.6 
 
 
369 aa  269  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.39 
 
 
395 aa  269  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.42 
 
 
380 aa  269  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.42 
 
 
380 aa  269  7e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1307  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.24 
 
 
387 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.77 
 
 
383 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.27 
 
 
383 aa  268  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.8 
 
 
366 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
394 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  36 
 
 
394 aa  267  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1408  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.24 
 
 
387 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.971065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2542  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.66 
 
 
387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1321  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.62 
 
 
391 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
397 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.4 
 
 
365 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
397 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.74 
 
 
373 aa  266  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
397 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
397 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
397 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.47 
 
 
374 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.84 
 
 
388 aa  266  5.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.47 
 
 
374 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.47 
 
 
374 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.4 
 
 
371 aa  265  8e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.53 
 
 
366 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.47 
 
 
374 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.46 
 
 
397 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
472 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.9 
 
 
375 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14600  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.9 
 
 
372 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0560  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.39 
 
 
424 aa  263  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.37 
 
 
381 aa  263  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.05 
 
 
384 aa  262  8e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0599  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.09 
 
 
435 aa  262  8e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.84 
 
 
381 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.07 
 
 
373 aa  262  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40480  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.1 
 
 
371 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2876  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.4 
 
 
377 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.87 
 
 
371 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.69 
 
 
384 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  37 
 
 
387 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2402  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.7 
 
 
726 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0899  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.5 
 
 
373 aa  260  4e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.9 
 
 
379 aa  259  4e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.4 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.24 
 
 
368 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>