297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_tRNASerVIMSS1309205 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.087026  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309205  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.98258  normal  0.324955 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309091  tRNA-Ser  97.7 
 
 
87 bp  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0021  tRNA-Ser  97.7 
 
 
87 bp  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146581  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309106  tRNA-Ser  96.55 
 
 
87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309375  tRNA-Ser  96.55 
 
 
87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.748623  hitchhiker  0.000994808 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309260  tRNA-Ser  96.55 
 
 
87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309165  tRNA-Ser  95.4 
 
 
87 bp  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0014  tRNA-Ser  95.4 
 
 
90 bp  141  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0037  tRNA-Ser  95.4 
 
 
87 bp  141  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.489158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0001  tRNA-Ser  93.1 
 
 
87 bp  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0001  tRNA-Ser  93.1 
 
 
87 bp  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0023  tRNA-Ser  93.1 
 
 
87 bp  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0002  tRNA-Ser  90.8 
 
 
87 bp  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  89.66 
 
 
90 bp  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  89.66 
 
 
90 bp  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0047  tRNA-Ser  88.51 
 
 
87 bp  93.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  88.51 
 
 
90 bp  93.7  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  88.51 
 
 
90 bp  93.7  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  88.51 
 
 
90 bp  93.7  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  88.51 
 
 
90 bp  93.7  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  88.51 
 
 
92 bp  93.7  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  88.51 
 
 
90 bp  93.7  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA5  tRNA-Ser  87.36 
 
 
90 bp  85.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0419374  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0003  tRNA-Ser  87.36 
 
 
90 bp  85.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642958  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  87.36 
 
 
90 bp  85.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0308  tRNA-Ser  87.36 
 
 
90 bp  85.7  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0007  tRNA-Ser  97.78 
 
 
87 bp  81.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0008  tRNA-Ser  87.5 
 
 
90 bp  79.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1071  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t35  tRNA-Ser  86.21 
 
 
87 bp  77.8  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0001  tRNA-Ser  86.21 
 
 
90 bp  77.8  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0008    86.21 
 
 
90 bp  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0798492  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0002  tRNA-Ser  86.21 
 
 
90 bp  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0003  tRNA-Ser  86.21 
 
 
90 bp  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0003  tRNA-Ser  86.21 
 
 
90 bp  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0016  tRNA-Ser  86.21 
 
 
90 bp  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1783  tRNA-Ser  86.21 
 
 
92 bp  77.8  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.762858  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0009  tRNA-Ser  86.21 
 
 
90 bp  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.4364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0011  tRNA-Ser  95.65 
 
 
87 bp  75.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000281552  normal  0.938437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  86.36 
 
 
91 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0001  tRNA-Ser  85.06 
 
 
90 bp  69.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  85.06 
 
 
90 bp  69.9  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0004  tRNA-Ser  85.06 
 
 
90 bp  69.9  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.888303  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4577  tRNA-Ser  85.06 
 
 
90 bp  69.9  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0044  tRNA-Ser  85.06 
 
 
90 bp  69.9  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0015  tRNA-Ser  85.06 
 
 
90 bp  69.9  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109725  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0038  tRNA-Ser  85.06 
 
 
90 bp  69.9  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0033  tRNA-Ser  86.49 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2302  tRNA-Ser  85.53 
 
 
92 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27190  tRNA-Ser  85.53 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000521392  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0008  tRNA-Ser  83.91 
 
 
90 bp  61.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0052  tRNA-Ser  83.91 
 
 
90 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0046  tRNA-Ser  94.87 
 
 
90 bp  61.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0060  tRNA-Ser  84.34 
 
 
90 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0011  tRNA-Ser  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000337805  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0032  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  60  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0075389 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  60  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.416329 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60240  tRNA-Ser  85.14 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  58  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  58  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327404  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  58  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.179799  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt13  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  58  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.548362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  58  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  58  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.328322  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0035  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  58  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  58  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.325073  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0657  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  58  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.96086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  58  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000235294  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0057  tRNA-Ser  83.75 
 
 
90 bp  56  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.0269773 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0886  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000841076  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt18  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt19  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  56  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0656  tRNA-Ser  100 
 
 
95 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0019  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0993  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000644963  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0021  tRNA-Ser  84.09 
 
 
91 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0717904 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0032  tRNA-Ser  92.5 
 
 
90 bp  56  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716898  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0253572  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  82.76 
 
 
90 bp  54  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  82.76 
 
 
90 bp  54  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309122  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0004  tRNA-Ser  82.76 
 
 
90 bp  54  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  82.76 
 
 
90 bp  54  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0034  tRNA-Ser  82.76 
 
 
90 bp  54  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  82.76 
 
 
90 bp  54  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  54  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0059  tRNA-Ser  82.76 
 
 
90 bp  54  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0025  tRNA-Ser  82.76 
 
 
90 bp  54  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0039  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  54  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0032  tRNA-Ser  82.76 
 
 
90 bp  54  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309285  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0025  tRNA-Ser  82.76 
 
 
90 bp  54  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217878  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0026  tRNA-Ser  82.76 
 
 
90 bp  54  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23198  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0061  tRNA-Ser  82.76 
 
 
90 bp  54  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.318482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>