More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_21611 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  98.92 
 
 
372 aa  755    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 
372 aa  763    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.97 
 
 
365 aa  472  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  57.57 
 
 
375 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.22 
 
 
374 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.54 
 
 
359 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.04 
 
 
376 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.3 
 
 
369 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.3 
 
 
369 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.92 
 
 
370 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1780  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.92 
 
 
370 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.655467  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.12 
 
 
370 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.14 
 
 
372 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.81 
 
 
381 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  50.68 
 
 
378 aa  365  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.95 
 
 
370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.27 
 
 
381 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  47.28 
 
 
375 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  44.96 
 
 
367 aa  319  5e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  45.65 
 
 
372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.35 
 
 
366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.32 
 
 
366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.32 
 
 
366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.05 
 
 
366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.05 
 
 
366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.32 
 
 
366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.05 
 
 
366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.78 
 
 
366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.05 
 
 
366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.47 
 
 
364 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.67 
 
 
364 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.82 
 
 
366 aa  299  6e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.25 
 
 
366 aa  298  9e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.4 
 
 
360 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.48 
 
 
360 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.75 
 
 
360 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  42.05 
 
 
371 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.48 
 
 
360 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.11 
 
 
363 aa  290  4e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  40.75 
 
 
365 aa  288  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  40.11 
 
 
370 aa  282  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01654  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.86 
 
 
369 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.02 
 
 
441 aa  281  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0178  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.58 
 
 
362 aa  278  9e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.146261 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.56 
 
 
363 aa  278  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00861  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.43 
 
 
359 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  40.11 
 
 
367 aa  275  9e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  39.57 
 
 
371 aa  275  9e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.45 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.16 
 
 
364 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  40.05 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.98 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.843588  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3329  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.58 
 
 
375 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0500  glycine cleavage system T protein  41.02 
 
 
371 aa  273  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.98 
 
 
368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  39.78 
 
 
366 aa  272  8.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  38.5 
 
 
389 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  37.47 
 
 
363 aa  269  5e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.3 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  38.73 
 
 
364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  38.98 
 
 
365 aa  269  7e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3480  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.9 
 
 
375 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.14 
 
 
370 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.81 
 
 
364 aa  267  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.64 
 
 
360 aa  267  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0117  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.08 
 
 
360 aa  267  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  39.08 
 
 
364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1559  aminomethyltransferase  41.51 
 
 
371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5428  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.57 
 
 
360 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0297013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  40.33 
 
 
351 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.5 
 
 
363 aa  265  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.5 
 
 
363 aa  265  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1904  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.43 
 
 
383 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0806  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.47 
 
 
390 aa  265  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000414833  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68870  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.19 
 
 
360 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.16 
 
 
383 aa  264  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00965774  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3592  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.71 
 
 
359 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3619  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.48 
 
 
364 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3801  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.02 
 
 
364 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.785369  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3677  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.75 
 
 
364 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.593611  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0617  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.02 
 
 
364 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.143333  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.71 
 
 
370 aa  262  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2463  aminomethyltransferase  39.89 
 
 
363 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27536  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  39.73 
 
 
360 aa  261  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.13 
 
 
365 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3211  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.02 
 
 
364 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00211141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3437  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.1 
 
 
366 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0350  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 
360 aa  260  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.536076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1274  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.91 
 
 
362 aa  260  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0799  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.42 
 
 
390 aa  260  3e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.172783  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5960  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.11 
 
 
360 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  38.06 
 
 
381 aa  259  7e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0779  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.48 
 
 
364 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.73 
 
 
363 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3830  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.11 
 
 
365 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.434299  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0246  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.3 
 
 
360 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0863  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.11 
 
 
365 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0867  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.11 
 
 
365 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3293  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.17 
 
 
375 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  38.65 
 
 
361 aa  256  6e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>