More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_21501 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  48.53 
 
 		 684 aa  676    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  52.1 
 
 		 674 aa  699    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21501  NAD-dependent DNA ligase  100 
 
 		 690 aa  1396    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1279  NAD-dependent DNA ligase  98.26 
 
 		 690 aa  1371    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.880494  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.47 
 
 		 697 aa  806    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.8 
 
 		 676 aa  711    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.67 
 
 		 738 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  53.64 
 
 		 680 aa  775    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.81 
 
 		 680 aa  803    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  51.98 
 
 		 679 aa  738    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  50.15 
 
 		 678 aa  695    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  52.25 
 
 		 674 aa  700    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29061  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.67 
 
 		 696 aa  788    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.83 
 
 		 774 aa  696    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.45 
 
 		 670 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  43.5 
 
 		 670 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  43.73 
 
 		 672 aa  590  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.56 
 
 		 670 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  41.91 
 
 		 677 aa  569  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.66 
 
 		 669 aa  569  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.21 
 
 		 673 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.66 
 
 		 669 aa  568  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.51 
 
 		 669 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.66 
 
 		 669 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  44.28 
 
 		 663 aa  569  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.59 
 
 		 669 aa  569  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  43.24 
 
 		 673 aa  569  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.81 
 
 		 669 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.96 
 
 		 669 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.51 
 
 		 669 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.66 
 
 		 669 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.51 
 
 		 669 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.66 
 
 		 669 aa  568  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  43.53 
 
 		 688 aa  561  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  43.53 
 
 		 688 aa  561  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  45.81 
 
 		 662 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  42 
 
 		 659 aa  558  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  42.04 
 
 		 673 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  42.18 
 
 		 673 aa  558  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.73 
 
 		 670 aa  556  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.65 
 
 		 670 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.65 
 
 		 670 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.43 
 
 		 684 aa  558  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  42 
 
 		 673 aa  558  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.98 
 
 		 681 aa  557  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.94 
 
 		 671 aa  552  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  39.71 
 
 		 671 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  42.52 
 
 		 683 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  43.99 
 
 		 663 aa  554  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.75 
 
 		 681 aa  553  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0801  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.62 
 
 		 682 aa  554  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  42.94 
 
 		 671 aa  555  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  42.35 
 
 		 672 aa  554  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  41.85 
 
 		 678 aa  554  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.79 
 
 		 671 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  42.23 
 
 		 671 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  41.79 
 
 		 671 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  42.46 
 
 		 690 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  41.72 
 
 		 711 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.79 
 
 		 671 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  43.37 
 
 		 671 aa  549  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  42.21 
 
 		 691 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.79 
 
 		 671 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  41.92 
 
 		 691 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.23 
 
 		 671 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.23 
 
 		 671 aa  550  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  42.21 
 
 		 746 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  42.21 
 
 		 691 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  41.94 
 
 		 691 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  42.21 
 
 		 691 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.09 
 
 		 669 aa  549  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  42.36 
 
 		 691 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.52 
 
 		 670 aa  546  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  42.96 
 
 		 681 aa  548  1e-154  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.38 
 
 		 673 aa  545  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  42.07 
 
 		 691 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.74 
 
 		 669 aa  544  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  42.6 
 
 		 684 aa  543  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  42.48 
 
 		 674 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  42.52 
 
 		 688 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.41 
 
 		 671 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  41.63 
 
 		 691 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  41.63 
 
 		 691 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  41.63 
 
 		 691 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.47 
 
 		 671 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  41.81 
 
 		 666 aa  539  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  42.38 
 
 		 688 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.47 
 
 		 671 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.32 
 
 		 671 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.47 
 
 		 671 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  41.7 
 
 		 672 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  41.63 
 
 		 691 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  41.63 
 
 		 691 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  42.66 
 
 		 672 aa  536  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.32 
 
 		 671 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  41.63 
 
 		 691 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  41.46 
 
 		 690 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  41.72 
 
 		 667 aa  536  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  39.94 
 
 		 694 aa  537  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  41.63 
 
 		 691 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>