More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_20001 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
287 aa  581  1e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
287 aa  581  1e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  89.55 
 
 
287 aa  539  1e-152  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  89.9 
 
 
287 aa  538  1e-152  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16751  50S ribosomal protein L2  89.9 
 
 
287 aa  513  1e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  87.11 
 
 
287 aa  505  1e-142  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17461  50S ribosomal protein L2  88.15 
 
 
287 aa  505  1e-142  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17371  50S ribosomal protein L2  87.11 
 
 
287 aa  500  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1647  50S ribosomal protein L2  87.8 
 
 
287 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17621  50S ribosomal protein L2  88.15 
 
 
287 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  72.59 
 
 
287 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  72.26 
 
 
276 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  72.26 
 
 
276 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  69.69 
 
 
287 aa  417  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  70.65 
 
 
277 aa  416  1e-115  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  66.42 
 
 
287 aa  390  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1295  50S ribosomal protein L2  67.53 
 
 
287 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000231184  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  65.31 
 
 
287 aa  386  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  61.96 
 
 
276 aa  362  6e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 
276 aa  359  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.04251e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 
276 aa  359  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.90971e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 
276 aa  358  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 
276 aa  357  1e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 
276 aa  355  3e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.49417e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 
276 aa  355  3e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.80933e-09  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
276 aa  354  9e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.87869e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
276 aa  353  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.00839e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
276 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  5.12601e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  60.58 
 
 
275 aa  353  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
276 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.00516e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
276 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
276 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.38046e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
276 aa  353  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
276 aa  353  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  9.01221e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 
276 aa  352  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 
275 aa  352  6e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.5035e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 
276 aa  350  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.10614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 
275 aa  348  8e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  57.88 
 
 
280 aa  342  3e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  57.82 
 
 
275 aa  342  4e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 
275 aa  341  8e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 
275 aa  340  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  59.27 
 
 
273 aa  340  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 
277 aa  340  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  58.76 
 
 
277 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  58.76 
 
 
277 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 
275 aa  338  5e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  57.61 
 
 
277 aa  338  5e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  60.95 
 
 
275 aa  336  3e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  59.27 
 
 
277 aa  334  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 
277 aa  333  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.90927e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 
277 aa  333  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.99614e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  60.95 
 
 
281 aa  332  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.72816e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  55.8 
 
 
277 aa  332  4e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 
274 aa  332  5e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  57.61 
 
 
275 aa  330  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  56.16 
 
 
275 aa  330  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  59.49 
 
 
275 aa  328  9e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  6.88583e-06 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  57.61 
 
 
277 aa  326  2e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.95488e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  56.78 
 
 
276 aa  326  3e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  56.88 
 
 
276 aa  325  4e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  1.65173e-06 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  56.68 
 
 
281 aa  325  5e-88  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 
278 aa  325  5e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  3.4721e-28 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  58.57 
 
 
279 aa  325  7e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  59.23 
 
 
274 aa  325  8e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  55.43 
 
 
276 aa  324  1e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  5.61637e-06  decreased coverage  1.03379e-08 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  56.43 
 
 
281 aa  323  3e-87  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  56 
 
 
277 aa  322  5e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  58.03 
 
 
276 aa  320  2e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  55.8 
 
 
276 aa  319  4e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  55.11 
 
 
274 aa  318  6e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  55.84 
 
 
274 aa  318  7e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  55.47 
 
 
274 aa  316  3e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  57.61 
 
 
274 aa  316  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  57.61 
 
 
274 aa  316  3e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  58.3 
 
 
279 aa  315  4e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  54.74 
 
 
277 aa  315  5e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2616  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
275 aa  314  1e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0160883  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1864  50S ribosomal protein L2  59.27 
 
 
277 aa  313  2e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0213539  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  56.32 
 
 
279 aa  311  6e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  56.52 
 
 
275 aa  311  7e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 
274 aa  311  8e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 
274 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 
283 aa  308  5e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  54.51 
 
 
279 aa  308  5e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  2.63643e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 
274 aa  308  9e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  56.16 
 
 
274 aa  306  2e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.47453e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  58.03 
 
 
276 aa  306  2e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0770  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 
276 aa  307  2e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00209717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  56 
 
 
276 aa  305  8e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.22183e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  56 
 
 
276 aa  305  8e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  2.32502e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  58.03 
 
 
276 aa  304  1e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 
281 aa  303  3e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  3.49234e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  55.23 
 
 
279 aa  303  3e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  3.64134e-06  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  56.16 
 
 
274 aa  302  4e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.33663e-07  hitchhiker  8.56838e-12 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3992  ribosomal protein L2  55.07 
 
 
275 aa  300  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  54.74 
 
 
274 aa  300  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  57.4 
 
 
277 aa  299  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  56.16 
 
 
279 aa  299  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  56 
 
 
275 aa  299  4e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  9.03374e-11  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>