More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_19451 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_19451  chorismate mutase-prephenate dehydratase  100 
 
 		 276 aa  564  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1070  chorismate mutase-prephenate dehydratase  96.38 
 
 		 276 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.330771  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  64.87 
 
 		 281 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16951  chorismate mutase-prephenate dehydratase  63.8 
 
 		 281 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16841  chorismate mutase-prephenate dehydratase  62.37 
 
 		 281 aa  361  9e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17071  chorismate mutase-prephenate dehydratase  62.37 
 
 		 281 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.530579  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1596  chorismate mutase-prephenate dehydratase  62.72 
 
 		 281 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  57.19 
 
 		 304 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2026  prephenate dehydratase  58.84 
 
 		 282 aa  330  1e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.713159  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  58.48 
 
 		 291 aa  325  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  48.8 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  48.8 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  43.31 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  46.61 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  44.44 
 
 		 293 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  39.38 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  42.03 
 
 		 287 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  39.34 
 
 		 379 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  39.34 
 
 		 418 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  40.33 
 
 		 276 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4418  prephenate dehydratase  42.97 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  40.41 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  40.59 
 
 		 280 aa  169  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  39.36 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  39.34 
 
 		 272 aa  161  9e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  40.5 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  37.25 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  37.25 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  38.87 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  36.89 
 
 		 277 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  37.5 
 
 		 391 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  42.32 
 
 		 356 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  36.3 
 
 		 366 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  36.29 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  36.29 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  34.56 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.76 
 
 		 371 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  38.18 
 
 		 372 aa  149  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  34.52 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  33.22 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  35.38 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  35.77 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  34.56 
 
 		 358 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  34.69 
 
 		 372 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  38.52 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  36 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  34.07 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  34.63 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0264  prephenate dehydratase  39.41 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0450669  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  34.07 
 
 		 359 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  34.24 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  34.78 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  34.39 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  33.45 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  33.22 
 
 		 419 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  33.45 
 
 		 413 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1905  prephenate dehydratase  33.45 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  34.25 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3673  Prephenate dehydratase  34.87 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  33.58 
 
 		 349 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  33.82 
 
 		 359 aa  139  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  35.29 
 
 		 268 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  33.1 
 
 		 311 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  35.38 
 
 		 361 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0983  Prephenate dehydratase  34.85 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.432859 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  35.51 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  33.46 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  34.93 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  33.33 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  33.46 
 
 		 364 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  29.96 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  33.09 
 
 		 364 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  35.12 
 
 		 364 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  32.72 
 
 		 367 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.82 
 
 		 364 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  32.97 
 
 		 374 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  32.72 
 
 		 364 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  36 
 
 		 355 aa  135  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  31.75 
 
 		 318 aa  135  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  35.19 
 
 		 359 aa  135  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  33.46 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  35.39 
 
 		 364 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  33.81 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  34.3 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.55 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  33.94 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.77 
 
 		 358 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.56 
 
 		 368 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  33.82 
 
 		 365 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 317 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  36.13 
 
 		 360 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  35.39 
 
 		 365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  36.18 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1264  Prephenate dehydratase  33.46 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  35.39 
 
 		 365 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>