34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_18831 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_18831  putative high light inducible protein  100 
 
 
50 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1013  putative high light inducible protein  100 
 
 
50 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0608  putative high light inducible protein  70 
 
 
50 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131116  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16041  putative high light inducible protein  77.08 
 
 
50 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2064  hypothetical protein  68 
 
 
63 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0330706  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  72 
 
 
50 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1575  putative high light inducible protein  72 
 
 
50 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  72 
 
 
50 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  72 
 
 
50 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04401  putative high light inducible protein  58 
 
 
50 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  43.75 
 
 
56 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  46 
 
 
54 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  41.67 
 
 
56 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  42.55 
 
 
58 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  42.55 
 
 
58 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1997  high light-inducible protein  48.94 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  41.67 
 
 
59 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  46.81 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  38 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  41.67 
 
 
56 aa  50.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  46.81 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  50 
 
 
58 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  44.9 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  47.22 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  40.43 
 
 
71 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  28 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  42.55 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01281  high light inducible protein  36.17 
 
 
79 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0214149  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  51.43 
 
 
59 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00721  high light inducible protein  37.5 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.624875 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  38.1 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  30.61 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  42.55 
 
 
59 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1831  high light inducible protein  50 
 
 
83 aa  40.4  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>