More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_17011 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  100 
 
 
313 aa  638    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  98.72 
 
 
313 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  65.13 
 
 
319 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  62.95 
 
 
311 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  60.83 
 
 
314 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  61.64 
 
 
343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  59.6 
 
 
303 aa  349  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  58.61 
 
 
303 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  56.62 
 
 
303 aa  329  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  52.79 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  57.28 
 
 
303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  52.61 
 
 
314 aa  321  8e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  52.29 
 
 
314 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  53.82 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  54.67 
 
 
315 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  51.83 
 
 
310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  53.16 
 
 
318 aa  306  4.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  51.8 
 
 
318 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 
299 aa  282  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 
299 aa  282  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  46.05 
 
 
302 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  46.43 
 
 
302 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  46.75 
 
 
301 aa  276  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  45.13 
 
 
302 aa  275  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  46.89 
 
 
301 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 
299 aa  275  8e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  46.56 
 
 
301 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  44.26 
 
 
303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 
301 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 
301 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 
301 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 
301 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 
301 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 
301 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 
301 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  45.78 
 
 
301 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  46.86 
 
 
299 aa  270  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  46.36 
 
 
294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  44.84 
 
 
303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
297 aa  265  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  46.2 
 
 
299 aa  265  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  44.63 
 
 
303 aa  264  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  46.91 
 
 
301 aa  261  8.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  43.56 
 
 
301 aa  259  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  44.04 
 
 
298 aa  257  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  45.31 
 
 
300 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  43.87 
 
 
300 aa  257  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  43.71 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  47.02 
 
 
297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  43.28 
 
 
299 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  43.18 
 
 
308 aa  251  8.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  43.18 
 
 
298 aa  248  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  43.83 
 
 
303 aa  247  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  41.1 
 
 
297 aa  245  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 
298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  41.88 
 
 
305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 
300 aa  241  9e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 
301 aa  241  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 
303 aa  240  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  41.1 
 
 
297 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  40.72 
 
 
307 aa  239  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 
302 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  43.28 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 
301 aa  238  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 
296 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 
451 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  43.71 
 
 
307 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 
306 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  42.3 
 
 
296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 
299 aa  235  9e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 
489 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  38.54 
 
 
315 aa  233  3e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  42.16 
 
 
468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 
312 aa  232  8.000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  40.84 
 
 
305 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  43 
 
 
298 aa  231  9e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  40.97 
 
 
303 aa  228  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 
298 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 
293 aa  226  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  39.48 
 
 
301 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  38.56 
 
 
310 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  39.07 
 
 
324 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 
296 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 
315 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  40.53 
 
 
299 aa  218  1e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  38.82 
 
 
295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  37.7 
 
 
300 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  38.91 
 
 
296 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1743  GTP-binding protein Era  40.8 
 
 
293 aa  215  7e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  36.25 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0507  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 
301 aa  211  1e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000333853  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  40.97 
 
 
301 aa  210  3e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  38.44 
 
 
314 aa  210  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  37.13 
 
 
304 aa  209  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  38.76 
 
 
311 aa  209  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1919  GTP-binding protein Era  39.55 
 
 
313 aa  208  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247131  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  37.25 
 
 
299 aa  208  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  36.93 
 
 
305 aa  208  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>