More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_14681 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  63.14 
 
 
512 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  96.92 
 
 
520 aa  1044    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  71.11 
 
 
514 aa  745    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  59.45 
 
 
506 aa  663    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  67.18 
 
 
518 aa  763    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  66.86 
 
 
518 aa  757    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  70.85 
 
 
514 aa  743    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  63.78 
 
 
504 aa  691    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  58.88 
 
 
508 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  63.14 
 
 
512 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  62.96 
 
 
506 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  71.68 
 
 
516 aa  797    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  61.6 
 
 
532 aa  671    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  70.71 
 
 
514 aa  744    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  70.51 
 
 
514 aa  747    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  100 
 
 
520 aa  1075    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  71.34 
 
 
520 aa  800    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  41.93 
 
 
507 aa  419  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  42.57 
 
 
503 aa  413  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  41.67 
 
 
505 aa  411  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  40.82 
 
 
522 aa  409  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  42.13 
 
 
508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  41.19 
 
 
503 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  40.99 
 
 
503 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 
502 aa  286  7e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  32.51 
 
 
513 aa  274  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 
506 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 
515 aa  259  9e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  32.44 
 
 
497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  32.44 
 
 
497 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  29.34 
 
 
938 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 
512 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  31.45 
 
 
504 aa  229  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 
512 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  31.76 
 
 
509 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  31.76 
 
 
509 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  30 
 
 
554 aa  206  6e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  30.26 
 
 
595 aa  206  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  31.4 
 
 
509 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  30.86 
 
 
509 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  35.38 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  30.46 
 
 
511 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  30.49 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  31.4 
 
 
509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  28.49 
 
 
598 aa  187  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  31.54 
 
 
516 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  30.58 
 
 
510 aa  186  9e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  31.13 
 
 
645 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  29.84 
 
 
633 aa  178  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  28.41 
 
 
499 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 
501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  28.21 
 
 
530 aa  164  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  27.65 
 
 
504 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  27.44 
 
 
505 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  27.06 
 
 
523 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  27.22 
 
 
499 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  27.02 
 
 
499 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.66 
 
 
740 aa  145  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  26.87 
 
 
510 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  28.21 
 
 
635 aa  143  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  27.86 
 
 
711 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  27.41 
 
 
517 aa  139  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
717 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  26.25 
 
 
489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 
722 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26.26 
 
 
511 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  26.16 
 
 
708 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 
500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.19 
 
 
542 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  26.48 
 
 
502 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  24.65 
 
 
474 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  25.35 
 
 
507 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  23.51 
 
 
518 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  26.98 
 
 
491 aa  114  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  24 
 
 
501 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  25.56 
 
 
535 aa  113  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 
492 aa  113  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  24.77 
 
 
549 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  23.29 
 
 
507 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  23.54 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.29 
 
 
492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 
547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 
547 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.2 
 
 
511 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 
510 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.29 
 
 
544 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  24.37 
 
 
504 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  25.6 
 
 
512 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  22.6 
 
 
504 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  25.21 
 
 
495 aa  108  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  24.49 
 
 
511 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  24.1 
 
 
508 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  24.02 
 
 
505 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  24.41 
 
 
505 aa  107  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  25.1 
 
 
501 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.27 
 
 
511 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  21.76 
 
 
530 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  21.78 
 
 
492 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  24.27 
 
 
494 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  24.58 
 
 
492 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>