More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_10661 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_10431  ABC transporter  55.47 
 
 
548 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0384  multidrug ABC transporter  97.23 
 
 
578 aa  1099    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  54.15 
 
 
581 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0973  multidrug ABC transporter  55.04 
 
 
568 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  58.62 
 
 
592 aa  707    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10661  ABC transporter  100 
 
 
578 aa  1165    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480699  normal  0.0347251 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09401  ABC transporter  59.38 
 
 
580 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107359 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10431  ABC transporter  54.66 
 
 
547 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503648  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09021  ABC transporter  54.93 
 
 
548 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0832  ATPase  51.37 
 
 
552 aa  611  1e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.423533  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  43.95 
 
 
582 aa  508  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  45.77 
 
 
550 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  43.33 
 
 
578 aa  461  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  41.96 
 
 
575 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  41.74 
 
 
580 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  41.74 
 
 
580 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  42.99 
 
 
546 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  39.2 
 
 
578 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  36.23 
 
 
571 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  38.35 
 
 
575 aa  329  7e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  37.8 
 
 
556 aa  326  6e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.55 
 
 
572 aa  324  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.63 
 
 
601 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  32.79 
 
 
582 aa  323  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.08 
 
 
596 aa  321  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  34.92 
 
 
613 aa  320  6e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.57 
 
 
580 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.33 
 
 
579 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  34.86 
 
 
571 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.56 
 
 
578 aa  316  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.56 
 
 
578 aa  316  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.4 
 
 
578 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  34.97 
 
 
612 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.69 
 
 
587 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.04 
 
 
596 aa  313  6.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.46 
 
 
575 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.75 
 
 
585 aa  311  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.4 
 
 
598 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  35.4 
 
 
611 aa  310  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  32.21 
 
 
585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  32.92 
 
 
624 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.01 
 
 
580 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  36.7 
 
 
586 aa  303  6.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.55 
 
 
597 aa  302  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  34.64 
 
 
578 aa  302  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  33.33 
 
 
595 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  35.88 
 
 
598 aa  301  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  35.8 
 
 
601 aa  301  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  33.72 
 
 
627 aa  301  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  31.49 
 
 
591 aa  301  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.54 
 
 
579 aa  301  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  35.18 
 
 
613 aa  301  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  31.09 
 
 
614 aa  300  6e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  36.27 
 
 
598 aa  300  6e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  33.74 
 
 
566 aa  298  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  32.43 
 
 
617 aa  297  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  31.45 
 
 
586 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  36.55 
 
 
586 aa  296  6e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  34.29 
 
 
636 aa  296  8e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0351  hypothetical protein  33.59 
 
 
611 aa  296  8e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.378963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.76 
 
 
577 aa  296  8e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  31.81 
 
 
586 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  34.32 
 
 
598 aa  295  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.46 
 
 
572 aa  293  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1064  ABC transporter, transmembrane region  34.17 
 
 
602 aa  294  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.415501  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.46 
 
 
572 aa  293  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  34.84 
 
 
582 aa  293  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  32.55 
 
 
589 aa  293  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.95 
 
 
586 aa  293  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  31.44 
 
 
586 aa  293  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3335  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.63 
 
 
634 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  33.71 
 
 
601 aa  293  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.4 
 
 
571 aa  293  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  32.91 
 
 
595 aa  292  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  33.02 
 
 
571 aa  292  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.95 
 
 
586 aa  292  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.68 
 
 
586 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 
566 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  32.11 
 
 
608 aa  292  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.45 
 
 
644 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  35.03 
 
 
636 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  33.02 
 
 
571 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  31.5 
 
 
586 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.63 
 
 
634 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  33.83 
 
 
608 aa  291  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.02 
 
 
571 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.02 
 
 
571 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  34.87 
 
 
566 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  33.27 
 
 
613 aa  291  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.27 
 
 
587 aa  291  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.02 
 
 
571 aa  291  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.02 
 
 
571 aa  291  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.09 
 
 
597 aa  291  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.02 
 
 
571 aa  291  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.45 
 
 
644 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.95 
 
 
586 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.95 
 
 
586 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  33.89 
 
 
567 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.1 
 
 
567 aa  290  6e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  35.37 
 
 
611 aa  290  6e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>