More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_10151 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0342  methionyl-tRNA synthetase  97.87 
 
 
516 aa  1043    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.190132  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1140  methionyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 
514 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.266684  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10151  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 
516 aa  1067    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145983 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14741  methionyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 
515 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0426231 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08971  methionyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 
509 aa  624  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.931117  decreased coverage  0.000000449236 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1334  methionyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 
514 aa  621  1e-177  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0404003 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09951  methionyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 
514 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0934  methionyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 
511 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09481  methionyl-tRNA synthetase  58.51 
 
 
511 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09931  methionyl-tRNA synthetase  58.2 
 
 
514 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0902215  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1142  methionyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 
525 aa  535  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.873399  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  49.81 
 
 
530 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  49.81 
 
 
530 aa  535  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
530 aa  521  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
535 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
535 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
533 aa  511  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
531 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
511 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
509 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
510 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 
509 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
512 aa  413  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
508 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 
506 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
648 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
650 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
655 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
632 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
529 aa  402  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
526 aa  403  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
645 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
645 aa  405  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
493 aa  400  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 
509 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
509 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
653 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
634 aa  397  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
525 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
654 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
500 aa  394  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
638 aa  391  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
629 aa  389  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
629 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  39 
 
 
574 aa  392  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
650 aa  389  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
628 aa  387  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
530 aa  388  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
647 aa  386  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 
650 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
647 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1085  methionyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
536 aa  385  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
645 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
645 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
515 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0820  methionyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
519 aa  379  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0770055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
653 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
642 aa  380  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
629 aa  380  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
675 aa  375  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2158  methionyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
525 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.99655  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0352  methionyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 
545 aa  378  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338459  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0807  methionyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
506 aa  377  1e-103  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
519 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 
522 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 
533 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
514 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
660 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
515 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
660 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
515 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
518 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
660 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
660 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 
660 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
651 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
660 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
515 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
671 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
660 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
634 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
519 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
523 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
544 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
516 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
516 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2717  methionyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
514 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
638 aa  369  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2273  methionyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
519 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000444544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
512 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
517 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
722 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
660 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 
511 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
660 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4187  methionyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
522 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
660 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2681  methionyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
514 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1000  methionyl-tRNA synthetase  39 
 
 
506 aa  366  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>