134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_09291 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  100 
 
 		 99 aa  205  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  96.97 
 
 		 99 aa  199  9e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  70.83 
 
 		 115 aa  147  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  67.68 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  66.67 
 
 		 118 aa  143  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  65.66 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  51.58 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  51.02 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  46.39 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  40.4 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  47.31 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  47.31 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2283  anti-sigma-factor antagonist  42.39 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2311  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  51.61 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003528  anti-anti-sigma regulatory factor  36.14 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  31.58 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  25.26 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02233  hypothetical protein  38.89 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  24 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0312  hypothetical protein, putative anti-sigma factor antagonist  30.95 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  29.11 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  25.29 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  30.38 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  26.67 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  27.66 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  24.24 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  31.67 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.33 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  28.4 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  23.91 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  28.26 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  24.24 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  32.47 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.33 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  28.38 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  23.33 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  26 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.33 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  28.57 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  30.67 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  27.27 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  28.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.86 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  18.75 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  30.26 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  26.23 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  31.67 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1681  anti-anti-sigma factor family protein  24.71 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  39.66 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  30.38 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  25.58 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  22.92 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  22.22 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.23 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4774  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558891  hitchhiker  0.00959736 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  23 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  21.21 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  22.22 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  22.22 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  22.22 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.03 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  22.11 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  30.38 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  28.05 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  21.57 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  24.42 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  33.93 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  25.84 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  30.68 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  28.95 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  24.27 
 
 		 112 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  27.14 
 
 		 115 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1812  hypothetical protein  57.14 
 
 		 41 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  30.51 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>