More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_09141 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  97.43 
 
 		 583 aa  1159    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  54.15 
 
 		 586 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  54.17 
 
 		 586 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 583 aa  1191    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  56.08 
 
 		 578 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  54.37 
 
 		 589 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  53.98 
 
 		 586 aa  643    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  46.7 
 
 		 575 aa  551  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  48.34 
 
 		 575 aa  541  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  37.13 
 
 		 585 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  36.16 
 
 		 578 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  36.16 
 
 		 578 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  36.16 
 
 		 578 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  34.97 
 
 		 577 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  35.52 
 
 		 587 aa  369  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  35.43 
 
 		 555 aa  364  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  36.38 
 
 		 589 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  34.71 
 
 		 591 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  36.24 
 
 		 556 aa  360  5e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  35.07 
 
 		 596 aa  359  7e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  33.14 
 
 		 581 aa  354  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  33.77 
 
 		 586 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  32.37 
 
 		 598 aa  350  5e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  34.76 
 
 		 584 aa  350  6e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  34.21 
 
 		 568 aa  347  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  34.4 
 
 		 544 aa  337  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  34.15 
 
 		 561 aa  333  6e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  32.96 
 
 		 565 aa  316  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  32.26 
 
 		 559 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  32.45 
 
 		 559 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  32.45 
 
 		 559 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  32.45 
 
 		 559 aa  312  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  32.45 
 
 		 559 aa  312  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  32.45 
 
 		 559 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  27.42 
 
 		 485 aa  177  5e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  26.88 
 
 		 492 aa  173  9e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  27.41 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  25.05 
 
 		 508 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  26.78 
 
 		 493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  26.47 
 
 		 489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  28.83 
 
 		 491 aa  163  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  26.02 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  26.07 
 
 		 494 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  26.02 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  26.07 
 
 		 494 aa  161  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  25.59 
 
 		 492 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  25.85 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  25.59 
 
 		 492 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  25.38 
 
 		 493 aa  153  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  25.43 
 
 		 641 aa  150  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  27.39 
 
 		 645 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  26.23 
 
 		 663 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  25.32 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  25.6 
 
 		 651 aa  137  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  23.98 
 
 		 644 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  25.27 
 
 		 498 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  25.84 
 
 		 649 aa  136  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  24.91 
 
 		 650 aa  134  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  24.9 
 
 		 650 aa  133  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  25.87 
 
 		 646 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  30.32 
 
 		 650 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  26.58 
 
 		 643 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  23.54 
 
 		 534 aa  128  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  24.15 
 
 		 636 aa  128  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  25.34 
 
 		 651 aa  127  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  24.57 
 
 		 638 aa  127  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  25.53 
 
 		 638 aa  126  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  26.14 
 
 		 652 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  22.71 
 
 		 661 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  24.84 
 
 		 650 aa  124  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  24.9 
 
 		 672 aa  117  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  23.58 
 
 		 657 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  23.38 
 
 		 645 aa  115  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  28.47 
 
 		 667 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  23.21 
 
 		 639 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  25.96 
 
 		 1085 aa  104  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  24.51 
 
 		 1092 aa  104  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  22.43 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  25.45 
 
 		 558 aa  102  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  24.09 
 
 		 1088 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  24.09 
 
 		 1088 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  24.09 
 
 		 1088 aa  101  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  24.44 
 
 		 1094 aa  100  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  20.97 
 
 		 1099 aa  101  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  25 
 
 		 1110 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  25.48 
 
 		 1123 aa  100  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  24.85 
 
 		 964 aa  100  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  24.92 
 
 		 551 aa  100  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  23.59 
 
 		 1088 aa  100  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  25 
 
 		 1112 aa  100  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  21.57 
 
 		 553 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  22.51 
 
 		 1098 aa  99.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  24.65 
 
 		 1111 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  24.3 
 
 		 1088 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  26.15 
 
 		 556 aa  98.2  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  25.66 
 
 		 598 aa  98.2  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  22.79 
 
 		 1098 aa  97.4  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  20.45 
 
 		 1100 aa  97.4  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  25.16 
 
 		 1112 aa  97.1  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  21.2 
 
 		 1121 aa  96.3  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>