More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_07421 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  97.83 
 
 		 368 aa  730    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 368 aa  742    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  64.13 
 
 		 372 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  61.41 
 
 		 370 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  59.94 
 
 		 371 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  59.78 
 
 		 377 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  55.96 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  53.33 
 
 		 363 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  53.5 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  55.25 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  53.22 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  52.66 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  52.89 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  54.7 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  54.75 
 
 		 366 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  54.75 
 
 		 366 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  53.46 
 
 		 364 aa  386  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  52.49 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  45.66 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  46.26 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1020  3-dehydroquinate synthase  44.75 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  43.3 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  46.24 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  44.04 
 
 		 358 aa  299  5e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  43.01 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  46.79 
 
 		 366 aa  296  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  46.76 
 
 		 360 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  43.9 
 
 		 362 aa  295  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  45.29 
 
 		 362 aa  291  9e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  43.31 
 
 		 362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 359 aa  288  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  43.56 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  45.32 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  43.18 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  44.01 
 
 		 356 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  44.92 
 
 		 374 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  42.5 
 
 		 358 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  42.66 
 
 		 359 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  42.66 
 
 		 359 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  42.5 
 
 		 358 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  42.5 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  42.5 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  43.33 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  42.54 
 
 		 539 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  43.42 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  43.14 
 
 		 370 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  42.11 
 
 		 359 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  41.99 
 
 		 361 aa  282  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  44.54 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  40.46 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  46.04 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  44.54 
 
 		 367 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  43.21 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 		 366 aa  279  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  43.06 
 
 		 360 aa  279  6e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 373 aa  279  6e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 359 aa  279  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 		 368 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  40.98 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  42.11 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  41.32 
 
 		 358 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  42.5 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  41.27 
 
 		 359 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  41.9 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  43.21 
 
 		 359 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  42.97 
 
 		 365 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  41.5 
 
 		 368 aa  276  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  42.73 
 
 		 360 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  45.16 
 
 		 362 aa  275  7e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 		 368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  42.03 
 
 		 361 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  43.98 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  41.48 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  41.34 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  42.21 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  43.98 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  42.23 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  42.34 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  41.48 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 365 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  41.83 
 
 		 366 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0093  3-dehydroquinate synthase  41.19 
 
 		 371 aa  272  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>