90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_03761 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  100 
 
 
338 aa  674    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  99.11 
 
 
338 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  63.1 
 
 
338 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03201  Ycf48-like protein  62.8 
 
 
338 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  62.8 
 
 
338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  63.72 
 
 
339 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0201  Ycf48-like protein  58.04 
 
 
333 aa  421  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.345386  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03291  Ycf48-like protein  58.28 
 
 
337 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.307197  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  60.95 
 
 
335 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0228  Ycf48-like protein  59.17 
 
 
333 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  41.59 
 
 
333 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  42.81 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  43.32 
 
 
339 aa  268  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  42.07 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  42.07 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  43.67 
 
 
349 aa  263  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  45.23 
 
 
340 aa  261  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  40.43 
 
 
337 aa  259  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47343  predicted protein  38.96 
 
 
363 aa  220  3e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770421  hitchhiker  0.000226051 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  37.03 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.31 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  27.88 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.35 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  33.6 
 
 
1120 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  27.39 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  35.25 
 
 
343 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  32.12 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  31.51 
 
 
346 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  21.8 
 
 
897 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  31.51 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  30.82 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.95 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  30.06 
 
 
323 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.06 
 
 
323 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  34.64 
 
 
363 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.15 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  32.61 
 
 
321 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  24.67 
 
 
359 aa  60.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.95 
 
 
321 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.66 
 
 
325 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.36 
 
 
322 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.36 
 
 
322 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  28.89 
 
 
361 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  25.63 
 
 
329 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.39 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  31.39 
 
 
340 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  29.1 
 
 
313 aa  56.2  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  28.89 
 
 
365 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  29.06 
 
 
363 aa  56.2  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.29 
 
 
352 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  35.64 
 
 
320 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  29.69 
 
 
742 aa  52.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  33.85 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  25.7 
 
 
421 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  29.77 
 
 
336 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.62 
 
 
324 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  31.97 
 
 
336 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  27.19 
 
 
382 aa  49.7  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  22.53 
 
 
344 aa  49.3  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 
334 aa  49.3  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  25.36 
 
 
1527 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  28.57 
 
 
363 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  28.1 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.6 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.43 
 
 
909 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  28.65 
 
 
331 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  26.2 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  35.48 
 
 
336 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.01 
 
 
314 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  35.94 
 
 
368 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  26.2 
 
 
336 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  30.16 
 
 
336 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  34.48 
 
 
338 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  28.41 
 
 
614 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  35.94 
 
 
354 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  26.57 
 
 
331 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  26.01 
 
 
335 aa  46.2  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  34.48 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.91 
 
 
371 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.58 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.44 
 
 
352 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  37.33 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  34.48 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  28.12 
 
 
1298 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  34.88 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  24.43 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  29.84 
 
 
372 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  40.28 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  23.79 
 
 
403 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.71 
 
 
366 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>