More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_02961 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1586  GTPase ObgE  99.09 
 
 
329 aa  655    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.928628  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02961  GTPase ObgE  100 
 
 
329 aa  662    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115383  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  71.04 
 
 
329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02391  GTPase ObgE  71.56 
 
 
329 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03941  GTPase ObgE  70.73 
 
 
329 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1824  GTPase ObgE  69.82 
 
 
329 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.853156  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  67.59 
 
 
327 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02391  GTPase ObgE  66.67 
 
 
327 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02381  GTPase ObgE  66.97 
 
 
327 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.636357  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0220  GTPase ObgE  70.1 
 
 
327 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.19 
 
 
350 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  61.77 
 
 
338 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  62.35 
 
 
329 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  62.35 
 
 
329 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  61.77 
 
 
343 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  63.8 
 
 
342 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  64.53 
 
 
359 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  62.27 
 
 
352 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  55.05 
 
 
346 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.37 
 
 
356 aa  295  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  51.06 
 
 
364 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  50.6 
 
 
405 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  49.39 
 
 
353 aa  293  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.99 
 
 
438 aa  293  4e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  51.06 
 
 
364 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.45 
 
 
426 aa  291  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  50.75 
 
 
397 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  50.15 
 
 
354 aa  290  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  51.06 
 
 
366 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  48.8 
 
 
406 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  51.37 
 
 
427 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3357  GTPase ObgE  53.35 
 
 
392 aa  289  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0207536  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  50.3 
 
 
372 aa  288  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  52.22 
 
 
397 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  50 
 
 
392 aa  287  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  49.69 
 
 
408 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  49.69 
 
 
408 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  49.07 
 
 
408 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  47.4 
 
 
337 aa  285  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  50 
 
 
392 aa  285  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  50.3 
 
 
370 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  50.3 
 
 
346 aa  285  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0527  GTPase ObgE  51.83 
 
 
386 aa  285  9e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  50.46 
 
 
370 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  49.69 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  49.85 
 
 
372 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  49.24 
 
 
365 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  53.33 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  51.38 
 
 
419 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  49.54 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  47.75 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  50 
 
 
406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  49.85 
 
 
372 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  49.85 
 
 
372 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  49.85 
 
 
372 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  49.85 
 
 
372 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  49.85 
 
 
372 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  49.85 
 
 
372 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  52.13 
 
 
390 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  48.44 
 
 
350 aa  282  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  50 
 
 
406 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  49.85 
 
 
362 aa  281  7.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  50.61 
 
 
392 aa  281  7.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  52.44 
 
 
390 aa  281  8.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  50.3 
 
 
390 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  49.24 
 
 
345 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  50.3 
 
 
390 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  48.64 
 
 
341 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  48.79 
 
 
407 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  50.3 
 
 
390 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  50.3 
 
 
390 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  50.3 
 
 
390 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  49.24 
 
 
387 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  50.31 
 
 
389 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  52.13 
 
 
391 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  49.24 
 
 
341 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.61 
 
 
390 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  50.61 
 
 
390 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.48 
 
 
369 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.09 
 
 
417 aa  279  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  49.54 
 
 
345 aa  279  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  50.15 
 
 
354 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  50.76 
 
 
347 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  48.77 
 
 
326 aa  279  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2855  GTPase ObgE  47.87 
 
 
395 aa  279  6e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000349951  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  50.15 
 
 
354 aa  278  7e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  50.15 
 
 
354 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.4 
 
 
429 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  49.09 
 
 
373 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  49.7 
 
 
430 aa  277  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  48.12 
 
 
332 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  49.7 
 
 
430 aa  277  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  48.32 
 
 
395 aa  276  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  52.31 
 
 
428 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  48.49 
 
 
370 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.76 
 
 
437 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  48.48 
 
 
407 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  51.69 
 
 
432 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  48.35 
 
 
362 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0956  GTPase ObgE  52.47 
 
 
386 aa  276  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>