More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_02021 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  100 
 
 
211 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  97.63 
 
 
211 aa  387  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  52.43 
 
 
216 aa  238  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  53.11 
 
 
209 aa  237  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  53.88 
 
 
209 aa  235  4e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  54.29 
 
 
215 aa  234  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  55.72 
 
 
212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  56.22 
 
 
212 aa  231  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  52.86 
 
 
210 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  55.22 
 
 
212 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  49.04 
 
 
225 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  40.85 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  42.31 
 
 
215 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  46.2 
 
 
211 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  42.51 
 
 
207 aa  165  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.13 
 
 
207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  41.43 
 
 
686 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  43.63 
 
 
199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  42.52 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  41.78 
 
 
234 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  48.37 
 
 
233 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  42.58 
 
 
707 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  43.15 
 
 
203 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  42.11 
 
 
222 aa  156  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.86 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  46.93 
 
 
204 aa  155  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  41.06 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  42.25 
 
 
206 aa  152  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  40 
 
 
205 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  45.81 
 
 
207 aa  151  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  41.43 
 
 
234 aa  151  8.999999999999999e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  41.04 
 
 
202 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  42.13 
 
 
214 aa  150  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  39.62 
 
 
212 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  36.28 
 
 
215 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  40.67 
 
 
208 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  43.89 
 
 
688 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  39.71 
 
 
901 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  37.68 
 
 
224 aa  148  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  42.05 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  40.74 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  41.21 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  39.81 
 
 
686 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  40.8 
 
 
213 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.94 
 
 
213 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  39.91 
 
 
203 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  41.41 
 
 
223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  38.03 
 
 
204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  39.52 
 
 
206 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  39.22 
 
 
221 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  40.19 
 
 
214 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  38.76 
 
 
217 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  38.5 
 
 
205 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  38.6 
 
 
212 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  39.63 
 
 
213 aa  143  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  40.69 
 
 
197 aa  142  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  38.86 
 
 
200 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  36.97 
 
 
671 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  38.18 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  36.84 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  44.85 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  41.43 
 
 
212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  39.62 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  44.97 
 
 
205 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  40.38 
 
 
206 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  43.82 
 
 
688 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  38.43 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  39.15 
 
 
223 aa  138  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  44.97 
 
 
205 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  38.89 
 
 
212 aa  138  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  37.98 
 
 
206 aa  138  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  39.23 
 
 
206 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  39.23 
 
 
206 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  39.23 
 
 
206 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  39.23 
 
 
206 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  38.65 
 
 
206 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  35.81 
 
 
219 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  37.8 
 
 
205 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  37.38 
 
 
219 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  39.23 
 
 
206 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  39.23 
 
 
206 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  38.1 
 
 
703 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  39.23 
 
 
206 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  39.42 
 
 
206 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  39.62 
 
 
210 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  38.65 
 
 
206 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  38.65 
 
 
206 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  36.97 
 
 
281 aa  136  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  35.43 
 
 
229 aa  136  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  38.65 
 
 
206 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  38.65 
 
 
206 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  37.74 
 
 
210 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  38.65 
 
 
206 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  37.16 
 
 
218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  37.8 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  37.85 
 
 
219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  38.68 
 
 
218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  37.09 
 
 
226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  36.97 
 
 
213 aa  135  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0547  thymidylate kinase  40.1 
 
 
199 aa  135  4e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>