More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_00561 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1375  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  99 
 
 		 616 aa  1024    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00471  flavoprotein  66.13 
 
 		 613 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.818961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2183  putative flavoprotein  62.7 
 
 		 598 aa  671    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2532  putative flavoprotein  61.09 
 
 		 597 aa  663    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28831  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  61.9 
 
 		 615 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00561  flavoprotein  100 
 
 		 500 aa  1031    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0043  flavoprotein  57 
 
 		 593 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00431  flavoprotein  56.97 
 
 		 600 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.175879  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00451  flavoprotein  57.55 
 
 		 600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00491  flavoprotein  55.29 
 
 		 600 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  46.76 
 
 		 574 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.4 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  45.71 
 
 		 570 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  45.03 
 
 		 584 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  47 
 
 		 573 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.6 
 
 		 573 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1438  flavin reductase-like, FMN-binding  43.69 
 
 		 597 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4139  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  43.46 
 
 		 601 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1162  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  44.42 
 
 		 569 aa  434  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.94 
 
 		 585 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  42.12 
 
 		 576 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36317  predicted protein  40.4 
 
 		 588 aa  395  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1369  flavin reductase-like, FMN-binding  40.6 
 
 		 575 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.018202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  38.97 
 
 		 571 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  38.57 
 
 		 571 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.73 
 
 		 575 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.76 
 
 		 575 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.76 
 
 		 575 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  35.21 
 
 		 571 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.7 
 
 		 574 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  35.04 
 
 		 575 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.44 
 
 		 575 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  35.67 
 
 		 572 aa  291  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00481  flavoprotein  35.54 
 
 		 589 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  33.78 
 
 		 576 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2180  flavoprotein  35.55 
 
 		 582 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28461  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  34.4 
 
 		 591 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.751796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.92 
 
 		 582 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.72 
 
 		 576 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.51 
 
 		 576 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00461  flavoprotein  34.16 
 
 		 591 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.551818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  34.35 
 
 		 579 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00501  flavoprotein  34.01 
 
 		 591 aa  277  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0044  flavoprotein  34.16 
 
 		 591 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00571  flavoprotein  34.93 
 
 		 592 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  33.84 
 
 		 574 aa  276  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1376  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 		 591 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2530  flavoprotein  34.01 
 
 		 582 aa  272  9e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.707378 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00441  flavoprotein  33.56 
 
 		 591 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119390  Diflavin flavoprotein A 1-like protein  33.41 
 
 		 638 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  33.07 
 
 		 397 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  29.9 
 
 		 878 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  29.57 
 
 		 878 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  31.44 
 
 		 399 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  31.06 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  28.85 
 
 		 508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 395 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  29.01 
 
 		 884 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  28.35 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  28.96 
 
 		 431 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  24.58 
 
 		 493 aa  124  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  26.35 
 
 		 479 aa  123  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.35 
 
 		 479 aa  123  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 392 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.04 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25 
 
 		 504 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27.76 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.6 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.03 
 
 		 479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  26.03 
 
 		 479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.03 
 
 		 479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.03 
 
 		 479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.9 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  29 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.03 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  24.22 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  27.88 
 
 		 407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 		 407 aa  120  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27.5 
 
 		 397 aa  120  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  25.45 
 
 		 392 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27.84 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.88 
 
 		 505 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 		 421 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.91 
 
 		 503 aa  117  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  26.36 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.52 
 
 		 494 aa  117  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.54 
 
 		 500 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 407 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.96 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.96 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0301118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>