More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6068 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  100 
 
 		 110 aa  219  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  93.64 
 
 		 109 aa  205  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  86.36 
 
 		 109 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  86.36 
 
 		 109 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  86.36 
 
 		 109 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  79.46 
 
 		 116 aa  179  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  74.29 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  70.48 
 
 		 108 aa  160  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  67.62 
 
 		 108 aa  155  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  66.67 
 
 		 108 aa  154  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  62.5 
 
 		 107 aa  148  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  68.75 
 
 		 111 aa  143  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  58.82 
 
 		 107 aa  133  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  60 
 
 		 108 aa  133  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  63.73 
 
 		 108 aa  133  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  59 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  62.63 
 
 		 141 aa  127  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  57.29 
 
 		 107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  55.88 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  57.69 
 
 		 106 aa  126  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  53.92 
 
 		 110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  49.09 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  59.18 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  51.46 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  55.1 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  55.79 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  56.57 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0946  thioredoxin  50.91 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  52.88 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  52.38 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  54.64 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  56.31 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  58.43 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  51.43 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  53.33 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  57.29 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  52.38 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  60.23 
 
 		 141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  55.21 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  51.46 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  57.84 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  57.84 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  54.37 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  53.77 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  54.08 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  52.43 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  50.96 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  56.73 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  54.08 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  56.25 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  53.54 
 
 		 109 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  55.56 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  50.5 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  48.54 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  55 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  52.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  52.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  54.17 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  52.48 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  52.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  52.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  52.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  52.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  55.45 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  52.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  52.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  52.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  52.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  54.08 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  52.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  54.55 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  52.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  52.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  52.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  56.57 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  54.17 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  51.43 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  53.54 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  51.52 
 
 		 108 aa  114  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  52 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  51.96 
 
 		 108 aa  114  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  52.53 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  51.49 
 
 		 259 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  53.47 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  49.04 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  51.52 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  53.47 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  53.54 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  55.45 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  55.45 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  50.51 
 
 		 108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  49.52 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>