More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6048 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_6048  ABC transporter-related protein  100 
 
 
243 aa  485  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0164038  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0857  ABC transporter related  88.89 
 
 
243 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5384  ABC transporter related  82.43 
 
 
247 aa  410  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.773344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5760  ABC transporter related  82.85 
 
 
247 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5473  ABC transporter related  82.43 
 
 
247 aa  410  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3865  ABC transporter related protein  74.58 
 
 
249 aa  368  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2484  ABC transporter related  72.69 
 
 
245 aa  353  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000266476 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.61 
 
 
510 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.67 
 
 
516 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.45 
 
 
502 aa  301  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  60.17 
 
 
507 aa  294  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1981  ABC transporter related  63.03 
 
 
260 aa  285  5.999999999999999e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308178  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  56.36 
 
 
246 aa  276  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  56.49 
 
 
240 aa  275  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.05 
 
 
242 aa  275  4e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  53.97 
 
 
247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  55.7 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  56.07 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  55.27 
 
 
242 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  55.23 
 
 
241 aa  268  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.07 
 
 
242 aa  267  8.999999999999999e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  54.39 
 
 
241 aa  267  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  54.39 
 
 
241 aa  267  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 
241 aa  267  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  51.46 
 
 
255 aa  267  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 
269 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  55.13 
 
 
241 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  53.97 
 
 
246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  53.97 
 
 
241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  53.97 
 
 
253 aa  265  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  52.3 
 
 
242 aa  265  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.81 
 
 
244 aa  265  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 
249 aa  265  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  52.3 
 
 
240 aa  265  7e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  51.23 
 
 
269 aa  265  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.69 
 
 
244 aa  264  8e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  54.39 
 
 
240 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  51.46 
 
 
240 aa  263  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
251 aa  263  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2745  ABC transporter related  56.38 
 
 
248 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  54.39 
 
 
240 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  58.44 
 
 
246 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  53.85 
 
 
242 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.69 
 
 
249 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  58.44 
 
 
246 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  54.66 
 
 
242 aa  262  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  54.47 
 
 
241 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  54.04 
 
 
241 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
244 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  54.04 
 
 
241 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  51.44 
 
 
267 aa  261  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  54.04 
 
 
241 aa  261  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  58.44 
 
 
246 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.96 
 
 
244 aa  261  8e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  55.23 
 
 
244 aa  260  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.88 
 
 
247 aa  260  1e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  53.56 
 
 
241 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  51.88 
 
 
242 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  51.88 
 
 
242 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  53.78 
 
 
239 aa  259  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.28 
 
 
246 aa  259  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  51.91 
 
 
242 aa  259  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  51.84 
 
 
247 aa  259  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  54.89 
 
 
241 aa  259  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.36 
 
 
273 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  52.99 
 
 
242 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  55.08 
 
 
244 aa  259  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  53.14 
 
 
246 aa  259  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  53.19 
 
 
243 aa  258  4e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  54.04 
 
 
241 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 
240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  50.42 
 
 
249 aa  258  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  54.81 
 
 
254 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  54.81 
 
 
254 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  54.81 
 
 
242 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  52.05 
 
 
273 aa  257  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  54.31 
 
 
248 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  50 
 
 
249 aa  257  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  54.81 
 
 
255 aa  257  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  55.33 
 
 
252 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  54.35 
 
 
270 aa  256  2e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  51.03 
 
 
256 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  53.69 
 
 
261 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  52.77 
 
 
243 aa  256  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  52.52 
 
 
253 aa  256  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  52.72 
 
 
246 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  52.87 
 
 
246 aa  256  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  50.42 
 
 
249 aa  256  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.78 
 
 
240 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  49.79 
 
 
240 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 
244 aa  256  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.89 
 
 
249 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  49.39 
 
 
268 aa  255  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  54.43 
 
 
248 aa  255  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  51.03 
 
 
246 aa  255  5e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  54.78 
 
 
246 aa  255  5e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  52.77 
 
 
243 aa  255  6e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.69 
 
 
244 aa  255  6e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 
240 aa  254  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  52.08 
 
 
241 aa  254  7e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>