More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6046 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_6046  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0859  regulatory protein GntR, HTH  77.31 
 
 		 217 aa  348  4e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.774142  decreased coverage  0.0091053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10042  GntR family transcriptional regulator  60.27 
 
 		 244 aa  277  8e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5382  GntR family transcriptional regulator  59.53 
 
 		 220 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5471  GntR family transcriptional regulator  59.53 
 
 		 220 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5758  GntR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 220 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2517  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1565  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2514  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 273 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00436634  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3933  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 282 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.903638  decreased coverage  0.00636181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  32.88 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  32.09 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  25.81 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  38.39 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2904  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 396 aa  62  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  31.19 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  27.64 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1568  transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  26.67 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  26.11 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  25.7 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  31.08 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  28.89 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  29.73 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  29.75 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  29.38 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  24.34 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  29.37 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>