More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6042 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
298 aa  595  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  79.12 
 
 
298 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  76.11 
 
 
298 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  76.11 
 
 
298 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  76.11 
 
 
298 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  67.69 
 
 
298 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  45.24 
 
 
326 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
303 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
303 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
303 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 
268 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  34.1 
 
 
288 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
280 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  29.51 
 
 
293 aa  92.4  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  32.45 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 
300 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  28.11 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  32.59 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.84 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  31.25 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
285 aa  79  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 
258 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.78 
 
 
277 aa  77  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  23.01 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  25.75 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  24.22 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  22.77 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  29.64 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  26.99 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  24.39 
 
 
253 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.59 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  25.49 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  27.68 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  27.43 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 
254 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  28.21 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
286 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  27.4 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  27.4 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  27.4 
 
 
255 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  23.45 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.54 
 
 
343 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2094  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  37.9 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  21.51 
 
 
298 aa  62.8  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 
283 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  21.95 
 
 
235 aa  62.8  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  26.12 
 
 
265 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.68 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  24.9 
 
 
259 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.3 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  24.75 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  25.65 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  22.5 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.41 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  25.78 
 
 
260 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>