More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5939 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  100 
 
 
395 aa  789    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  47.77 
 
 
304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0372  integrase family protein  40.7 
 
 
411 aa  237  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  38.06 
 
 
408 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1271  phage integrase  34.39 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896321  normal  0.0119714 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0438  phage integrase  38.54 
 
 
515 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2230  integrase family protein  32.34 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5350  integrase family protein  32.34 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.467969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2006  integrase family protein  32.34 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128243  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3264  phage integrase family protein  32.01 
 
 
403 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0777  integrase family protein  33.75 
 
 
425 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000241017 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0770  integrase family protein  33.17 
 
 
417 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000130395 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3698  integrase family protein  31.51 
 
 
508 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4004  integrase family protein  31.51 
 
 
508 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  33.85 
 
 
418 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3507  phage integrase family protein  30.73 
 
 
403 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5406  phage integrase family protein  30.94 
 
 
381 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.197458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0602  phage integrase family protein  30.96 
 
 
412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  33.54 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  31.42 
 
 
409 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2984  integrase family protein  32.09 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.443483  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4387  integrase family protein  32.09 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.864459  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1215  integrase family protein  32.09 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4357  integrase family protein  32.09 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196214  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0507  site-specific recombinase, phage integrase family  36.43 
 
 
414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0326  integrase family protein  36.43 
 
 
414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.061717 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4899  integrase family protein  32.62 
 
 
419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2397  site-specific recombinase, phage integrase family  36.43 
 
 
414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0669  integrase family protein  36.43 
 
 
414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0835  site-specific recombinase, phage integrase family  36.43 
 
 
414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2279  integrase family protein  28.73 
 
 
394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0687446  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8262  integrase/recombinase  32.01 
 
 
325 aa  129  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  31.75 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1239  phage integrase  27.36 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.183742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.76 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0711  phage integrase  34.4 
 
 
414 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.209263  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 
299 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 
299 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 
299 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 
299 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  29 
 
 
299 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0243  integrase family protein  29.66 
 
 
408 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 
299 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  27.84 
 
 
405 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.67 
 
 
299 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7622  integrase family protein  30.35 
 
 
405 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.530017 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  31.21 
 
 
311 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  29.17 
 
 
298 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 
309 aa  97.1  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  29.68 
 
 
302 aa  96.3  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4018  phage integrase family protein  33.47 
 
 
409 aa  94.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  25.61 
 
 
307 aa  93.6  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  28.62 
 
 
294 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9020  integrase/recombinase  31.69 
 
 
255 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  27.4 
 
 
299 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.81 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  30.89 
 
 
318 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  23.47 
 
 
295 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  29.08 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 
318 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 
318 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  31.02 
 
 
311 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0740  putative integrase  31.06 
 
 
171 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.650968  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  24.32 
 
 
298 aa  89.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.96 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.83 
 
 
291 aa  87.8  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  31.58 
 
 
303 aa  87  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  23.59 
 
 
310 aa  86.7  6e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  32.52 
 
 
304 aa  86.7  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.21 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2214  integrase domain protein SAM domain protein  24.76 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000184093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  28.2 
 
 
320 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  27.27 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  27.8 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  28.42 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.52 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  26.62 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 
302 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  23.97 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1436  integrase family protein  26.02 
 
 
641 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.35 
 
 
296 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  31.79 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2243  integrase family protein  27.76 
 
 
634 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  26.3 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.69 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.35 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.35 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.69 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.69 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.69 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.35 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.69 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  28.66 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
296 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  26.23 
 
 
295 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.85 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>