More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5684 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  63.06 
 
 		 221 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  29.17 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 213 aa  62  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  31.65 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  41.86 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 770 aa  55.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  26.75 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3333  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0249  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2967  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699652  normal  0.0717993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  36.21 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 238 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>