More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5628 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  100 
 
 
260 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  93.08 
 
 
260 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  80.92 
 
 
256 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  80.92 
 
 
256 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  80.92 
 
 
256 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  77.69 
 
 
254 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  64.86 
 
 
251 aa  328  7e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.41 
 
 
253 aa  323  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.23 
 
 
254 aa  314  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.57 
 
 
257 aa  222  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 
251 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
249 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  42.06 
 
 
255 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  41.96 
 
 
247 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
256 aa  159  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
249 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
247 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
246 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
247 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  41.75 
 
 
249 aa  132  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  34.13 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  31.01 
 
 
243 aa  122  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 
244 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  32.56 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  32.28 
 
 
246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  31.35 
 
 
245 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  30.12 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
245 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 
246 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
252 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
248 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
246 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  28.69 
 
 
240 aa  102  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  32.69 
 
 
249 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.11 
 
 
250 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  30.12 
 
 
246 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
247 aa  98.6  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.68 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 
243 aa  97.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  28.92 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 
248 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
254 aa  92  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.2 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  31.35 
 
 
270 aa  87  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
245 aa  85.5  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  30.41 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0621  hypothetical protein  27.51 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0604  hypothetical protein  26.98 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.67 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.02 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.02 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  28.85 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  30.11 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  27.87 
 
 
292 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1744  short chain dehydrogenase  29.95 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324234  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  27.87 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  28.06 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.05 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  34.71 
 
 
278 aa  59.7  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.72 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.8 
 
 
242 aa  59.7  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.48 
 
 
282 aa  59.3  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.74 
 
 
275 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  30.73 
 
 
276 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.32 
 
 
265 aa  58.5  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  30.91 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  27.13 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  27.66 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12310  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  31.76 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.3676  normal  0.223065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  27.66 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  29.68 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 
223 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  27.66 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0685  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24.15 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.09 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10628  short chain dehydrogenase  27.93 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.35 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.73 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3539  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.79 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.03 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  31.54 
 
 
274 aa  57  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
264 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04080  hypothetical protein  31.25 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>