More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5576 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  93.64 
 
 
503 aa  918    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
503 aa  1008    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  80.76 
 
 
489 aa  774    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  80.76 
 
 
489 aa  774    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  80.55 
 
 
489 aa  772    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.51 
 
 
483 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  70.91 
 
 
222 aa  310  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  34.32 
 
 
502 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  34.52 
 
 
502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1127  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.79 
 
 
217 aa  280  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  60.54 
 
 
268 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.39 
 
 
513 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1927  amino acid ABC transporter permease  57.83 
 
 
245 aa  268  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.02 
 
 
232 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.55 
 
 
245 aa  265  1e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  61.06 
 
 
235 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  61.06 
 
 
235 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  60.1 
 
 
234 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  60.58 
 
 
232 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  60.58 
 
 
226 aa  259  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  61.06 
 
 
209 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  60.1 
 
 
209 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  60.1 
 
 
209 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.58 
 
 
232 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.05 
 
 
221 aa  257  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  59.62 
 
 
209 aa  258  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  35.31 
 
 
501 aa  249  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0211  amino acid ABC transporter, permease  55.91 
 
 
238 aa  249  6e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  52.97 
 
 
273 aa  244  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.95 
 
 
493 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.54 
 
 
226 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7225  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  56.4 
 
 
219 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1126  extracellular solute-binding protein family 3  51.11 
 
 
271 aa  226  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0639  amino acid ABC transporter, permease protein  55.14 
 
 
226 aa  225  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.02 
 
 
492 aa  225  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0780  amino-acid ABC transporter permease protein YckJ  50 
 
 
210 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3137  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.67 
 
 
226 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.490493  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1759  putative ABC transporter, permease protein  51.1 
 
 
228 aa  221  3e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00086145  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  44.94 
 
 
257 aa  220  5e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  28.28 
 
 
714 aa  220  5e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1433  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  53.27 
 
 
225 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2685  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.27 
 
 
225 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310396  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1530  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.27 
 
 
225 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692251  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1927  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  53.02 
 
 
222 aa  219  1e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2004  amino acid ABC transporter, permease protein  50 
 
 
239 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0683  amino acid ABC transporter, permease protein  55.14 
 
 
226 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4923  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.14 
 
 
226 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44.44 
 
 
260 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2505  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.31 
 
 
222 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.110474  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  29.07 
 
 
727 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  45.26 
 
 
260 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2486  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.13 
 
 
239 aa  214  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2438  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.13 
 
 
239 aa  214  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.39 
 
 
222 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000424447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1721  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.39 
 
 
222 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2017  L-cystine ABC transporter, permease protein  51.39 
 
 
222 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0245386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1264  L-cystine ABC transporter, permease protein  51.39 
 
 
222 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0917804  normal  0.0118842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2152  L-cystine ABC transporter, permease protein  50.93 
 
 
222 aa  213  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00489018  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3809  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.14 
 
 
226 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217289  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  49.77 
 
 
222 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2692  L-cystine ABC transporter, permease protein  50.93 
 
 
222 aa  212  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0324102  normal  0.0361809 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1758  hook assembly protein, flagella  45.71 
 
 
250 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000345404  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  40.68 
 
 
259 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1046  L-cystine ABC transporter, permease protein  50.93 
 
 
222 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0095554  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  40.68 
 
 
259 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.77 
 
 
222 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  46.05 
 
 
257 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3836  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.61 
 
 
226 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.82 
 
 
485 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.82 
 
 
485 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  40.53 
 
 
262 aa  210  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.3 
 
 
222 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.93 
 
 
221 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.571407  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2114  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  50.93 
 
 
222 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000270288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  42.37 
 
 
265 aa  211  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2062  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.39 
 
 
499 aa  210  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2167  L-cystine transport system permease TcyB  50.93 
 
 
222 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0765863  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  45.61 
 
 
257 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  42.08 
 
 
265 aa  209  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  41.98 
 
 
265 aa  209  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  41 
 
 
255 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  41.98 
 
 
265 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0243  amino acid ABC transporter permease  57.63 
 
 
221 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1168  amino acid ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family, permease protein  50.93 
 
 
222 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.066667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  41.98 
 
 
265 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2108  amino acid ABC transporter His/Glu/Gln/Arg/opine family, permease  50.93 
 
 
222 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0113123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  41.98 
 
 
265 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  41.98 
 
 
265 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4924  extracellular solute-binding protein  45.22 
 
 
261 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263703 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  28.82 
 
 
485 aa  208  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  41.6 
 
 
265 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  41.6 
 
 
265 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  41.6 
 
 
265 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.8 
 
 
257 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  46.09 
 
 
260 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  46.09 
 
 
260 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.8 
 
 
257 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1291  His/Glu/Gln/Arg/opine family amino acid ABC transporter permease  50.46 
 
 
222 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2935  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.61 
 
 
220 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4163  extracellular solute-binding protein family 3  45.18 
 
 
257 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>