More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5565 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1243  aminotransferase class-III  96.95 
 
 
426 aa  855    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000210523  hitchhiker  0.000012077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0198  aminotransferase  86.9 
 
 
425 aa  768    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0207  aminotransferase  86.9 
 
 
425 aa  768    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5565  aminotransferase class-III  100 
 
 
426 aa  878    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0187  aminotransferase  86.56 
 
 
425 aa  771    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0659  aminotransferase class-III  59.62 
 
 
428 aa  548  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2247  putative aminotransferase  50.37 
 
 
410 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1070  aminotransferase class-III  30.43 
 
 
460 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  31.86 
 
 
411 aa  203  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.2 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.25 
 
 
459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  32.13 
 
 
411 aa  200  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  31.88 
 
 
475 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  31.24 
 
 
475 aa  196  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.46 
 
 
459 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.7 
 
 
429 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.2 
 
 
459 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.2 
 
 
459 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.2 
 
 
459 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.7 
 
 
429 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.2 
 
 
459 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.47 
 
 
429 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.7 
 
 
459 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  32.72 
 
 
468 aa  193  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.72 
 
 
429 aa  193  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  32.72 
 
 
459 aa  193  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  32.72 
 
 
429 aa  193  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.32 
 
 
477 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.86 
 
 
472 aa  189  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.47 
 
 
472 aa  189  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3034  aminotransferase  32.33 
 
 
433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.3 
 
 
477 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  29.38 
 
 
467 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0117  aminotransferase class-III  29.74 
 
 
421 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0673472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  34.17 
 
 
460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  29.41 
 
 
462 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  33.69 
 
 
457 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  34.82 
 
 
845 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  32.79 
 
 
955 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5761  aminotransferase class-III  32.51 
 
 
438 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.38 
 
 
397 aa  166  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3279  aminotransferase  31.46 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.91 
 
 
391 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  33.23 
 
 
395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1633  aminotransferase  32.05 
 
 
360 aa  162  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.300646  hitchhiker  0.00646915 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1071  aminotransferase class-III  28.93 
 
 
402 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  29.22 
 
 
468 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  30.73 
 
 
462 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  31.87 
 
 
458 aa  160  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  32.74 
 
 
404 aa  159  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2885  aminotransferase class-III  30.73 
 
 
477 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0947361 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  28.9 
 
 
460 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  29.67 
 
 
463 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.51 
 
 
408 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2006  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  28.76 
 
 
450 aa  158  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.11 
 
 
406 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  30.26 
 
 
392 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.61 
 
 
375 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.68 
 
 
408 aa  156  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  29.38 
 
 
443 aa  156  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  29.33 
 
 
414 aa  155  9e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  28.42 
 
 
396 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  28.42 
 
 
396 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  27.56 
 
 
398 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  31.43 
 
 
406 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2857  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  31.73 
 
 
451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  32.36 
 
 
396 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1636  aminotransferase class-III  30.36 
 
 
403 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3215  aminotransferase class-III  30.96 
 
 
477 aa  153  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1426  acetylornithine aminotransferase  30.73 
 
 
400 aa  153  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  27.29 
 
 
445 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  30.81 
 
 
440 aa  152  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  28.99 
 
 
410 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.2 
 
 
398 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  31.91 
 
 
406 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  28.64 
 
 
386 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  30.75 
 
 
406 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.75 
 
 
406 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2818  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  31.51 
 
 
478 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  31.11 
 
 
400 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  30.34 
 
 
403 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.13 
 
 
403 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  30.75 
 
 
406 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0163  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.85 
 
 
401 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  30.75 
 
 
406 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  30.75 
 
 
406 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3606  aminotransferase, class III; 4-aminobutyrate aminotransferase  27.88 
 
 
472 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.360893  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  30.75 
 
 
406 aa  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  27.11 
 
 
432 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.87 
 
 
406 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  29.17 
 
 
386 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  29.41 
 
 
405 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.32 
 
 
406 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1728  aminotransferase class-III  28.3 
 
 
463 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00289082 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  30.29 
 
 
397 aa  150  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  29.44 
 
 
415 aa  150  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  28.84 
 
 
386 aa  150  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  30.54 
 
 
436 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  27.84 
 
 
399 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0547  4-aminobutyrate aminotransferase  29.38 
 
 
465 aa  149  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>