35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5553 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5553  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  440  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1248  hypothetical protein  80.84 
 
 
215 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0560994  decreased coverage  0.00000150811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2708  hypothetical protein  54.84 
 
 
223 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.463816  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2752  hypothetical protein  54.84 
 
 
223 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2738  hypothetical protein  54.84 
 
 
223 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526378  normal  0.0730468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1051  hypothetical protein  46.33 
 
 
187 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0539048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1978  hypothetical protein  32.08 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.628499  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2648  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 
219 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  40.2 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1251  beta-lactamase domain-containing protein  35.24 
 
 
196 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.809975  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 
299 aa  48.5  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14831  Zn-dependent hydrolase  27.66 
 
 
304 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.861965  normal  0.085675 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4330  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 
293 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  31.54 
 
 
294 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1778  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 
243 aa  45.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0392485  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  40.79 
 
 
369 aa  45.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.67 
 
 
294 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 
293 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.71 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  34.86 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  35.71 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  43.33 
 
 
294 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  34.21 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0646  Beta-lactamase-like  28.18 
 
 
298 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2615  hypothetical protein  36.76 
 
 
106 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  38.36 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 
243 aa  43.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
296 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  51.43 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.7 
 
 
208 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  40.54 
 
 
237 aa  42  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1050  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 
251 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.0270637 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 
245 aa  41.6  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15960  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.58 
 
 
269 aa  41.6  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>