More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5547 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  100 
 
 
241 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  87.17 
 
 
225 aa  387  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  83.7 
 
 
226 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  84.14 
 
 
226 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  84.14 
 
 
226 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  51.21 
 
 
221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  39.34 
 
 
280 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  35.07 
 
 
223 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  31.72 
 
 
239 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  33.02 
 
 
234 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  30.41 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  30.29 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  29.52 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.43 
 
 
186 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  30.53 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  30 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.7 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  30 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  30 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  27.93 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.62 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  27.86 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  31.31 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.98 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  25.74 
 
 
183 aa  71.6  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  29.81 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  28.64 
 
 
546 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  27.96 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  29.11 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.54 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  27.93 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.36 
 
 
584 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.02 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.15 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.35 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.42 
 
 
191 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  26.55 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  28.17 
 
 
202 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  33.67 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.87 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.65 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  25 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.57 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.02 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1959  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.34 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14382  normal  0.266961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  27.27 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  26.9 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.43 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.34 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  27.59 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2280  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.41 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  29.65 
 
 
173 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  25.84 
 
 
177 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.1 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  25.37 
 
 
178 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  29.52 
 
 
218 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0743  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.47 
 
 
223 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  23.59 
 
 
165 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.35 
 
 
233 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  45.31 
 
 
265 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  27.5 
 
 
169 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2003  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.34 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3155  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.07 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182044  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3536  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.68 
 
 
211 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.84 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  27.67 
 
 
180 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  26.53 
 
 
190 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  22.55 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.66 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  25.96 
 
 
196 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  24.88 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.21 
 
 
184 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.52 
 
 
207 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.73 
 
 
206 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.64 
 
 
209 aa  59.7  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.31 
 
 
269 aa  59.7  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  25.24 
 
 
228 aa  58.9  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  27.8 
 
 
230 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  25.37 
 
 
202 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  50.98 
 
 
221 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1022  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.32 
 
 
212 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  0.22083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.32 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  25.12 
 
 
194 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  49.02 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  49.02 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1328  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.81 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  28.89 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2608  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.32 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.469084  normal  0.0132416 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  25.29 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  23.9 
 
 
170 aa  57.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  22.97 
 
 
215 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  24.65 
 
 
194 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1350  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.29 
 
 
216 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.54 
 
 
324 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  29.19 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  43.04 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  27.54 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  46.15 
 
 
270 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  49.28 
 
 
178 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>