More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5543 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5543  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 359 aa  730    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1273  ATP-dependent DNA ligase  88.67 
 
 		 351 aa  641    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  86.32 
 
 		 353 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  86.32 
 
 		 353 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5284  ATP-dependent DNA ligase  86.17 
 
 		 311 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0415  ATP dependent DNA ligase  60.62 
 
 		 346 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4039  ATP dependent DNA ligase  57.76 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  55.65 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  53.64 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  53.8 
 
 		 354 aa  361  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5866  ATP-dependent DNA ligase  51.87 
 
 		 369 aa  355  5.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.884257  normal  0.301201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1254  ATP-dependent DNA ligase  53.17 
 
 		 366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  hitchhiker  0.000397091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  51.77 
 
 		 363 aa  345  8.999999999999999e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  52.62 
 
 		 353 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  52.62 
 
 		 353 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  52.47 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  52.89 
 
 		 353 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1489  ATP-dependent DNA ligase  51.78 
 
 		 369 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13763  ATP-dependent DNA ligase  51.36 
 
 		 358 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  49.45 
 
 		 357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  50.41 
 
 		 369 aa  328  8e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15600  ATP-dependent DNA ligase  52.3 
 
 		 366 aa  325  1e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.138561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1252  ATP dependent DNA ligase  51.38 
 
 		 348 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.804327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  51.82 
 
 		 346 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1376  ATP-dependent DNA ligase  48.47 
 
 		 360 aa  317  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.165882  normal  0.400562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0907  ATP-dependent DNA ligase  49.06 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2256  ATP dependent DNA ligase  51.92 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.209492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4038  ATP-dependent DNA ligase  48.11 
 
 		 365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0480  ATP-dependent DNA ligase  48.64 
 
 		 371 aa  309  5e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1674  ATP dependent DNA ligase  47.76 
 
 		 390 aa  306  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1579  ATP-dependent DNA ligase  49.31 
 
 		 358 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6355  ATP dependent DNA ligase  48.09 
 
 		 361 aa  297  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915888  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5820  ATP-dependent DNA ligase  45.8 
 
 		 358 aa  278  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5292  ATP-dependent DNA ligase  48.43 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5169  ATP-dependent DNA ligase  40.78 
 
 		 408 aa  269  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00454515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  40.64 
 
 		 374 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2700  ATP-dependent DNA ligase  43.27 
 
 		 365 aa  246  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4122  ATP-dependent DNA ligase  43.27 
 
 		 355 aa  242  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5212  ATP-dependent DNA ligase  41.42 
 
 		 339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0092  ATP-dependent DNA ligase  44 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3719  ATP-dependent DNA ligase  41.67 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0581582 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1585  ATP-dependent DNA ligase  42.49 
 
 		 350 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143721  normal  0.0720309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5554  ATP dependent DNA ligase  42.23 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  41.08 
 
 		 345 aa  222  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3905  ATP-dependent DNA ligase  41.8 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0816  ATP-dependent DNA ligase  43.58 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0864  ATP-dependent DNA ligase  44.2 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0868  ATP-dependent DNA ligase  43.71 
 
 		 341 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4500  ATP dependent DNA ligase  31.5 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2271  ATP dependent DNA ligase  33.23 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4283  ATP dependent DNA ligase  32.23 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.46921 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  31.81 
 
 		 608 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  29.97 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  31.14 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0119  ATP dependent DNA ligase  34.19 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.262895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  36.45 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  35.16 
 
 		 847 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32 
 
 		 858 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  28.53 
 
 		 902 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  31.88 
 
 		 495 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  33.02 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  36.68 
 
 		 816 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  32.24 
 
 		 477 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  25.45 
 
 		 307 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.02 
 
 		 582 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  31.8 
 
 		 358 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  27.43 
 
 		 871 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  31.42 
 
 		 759 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  30.06 
 
 		 864 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  33.84 
 
 		 815 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  30.93 
 
 		 766 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  31.36 
 
 		 852 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  29.71 
 
 		 758 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  29.71 
 
 		 758 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  28.36 
 
 		 872 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  28.9 
 
 		 845 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  29.1 
 
 		 877 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  29.82 
 
 		 758 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.62 
 
 		 797 aa  89.4  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6989  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  28.16 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  28.88 
 
 		 847 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  29.68 
 
 		 763 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  32.36 
 
 		 513 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  29.97 
 
 		 822 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  30.32 
 
 		 603 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03420  ATP dependent DNA ligase  24.66 
 
 		 285 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  28.75 
 
 		 847 aa  86.3  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7010  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  28.57 
 
 		 350 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2396  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  28.27 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0138  ATP dependent DNA ligase  26.95 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.465735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  32.17 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  32.74 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1470  ATP dependent DNA ligase  34.25 
 
 		 542 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  28.66 
 
 		 656 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1305  DNA polymerase LigD ligase region  32.17 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  31.99 
 
 		 831 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  30.26 
 
 		 825 aa  83.6  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  29.57 
 
 		 832 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  27.76 
 
 		 901 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  28.53 
 
 		 534 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>