More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5418 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0512  phage integrase family protein  100 
 
 
399 aa  801    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5398  phage integrase family protein  100 
 
 
399 aa  801    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  84.13 
 
 
401 aa  672    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5418  phage integrase family protein  100 
 
 
399 aa  801    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3044  integrase family protein  41.97 
 
 
393 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169579  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3740  integrase family protein  41.97 
 
 
393 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1215  integrase family protein  41.97 
 
 
393 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0266422  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3603  integrase family protein  41.97 
 
 
393 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185249  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3585  integrase family protein  41.97 
 
 
393 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0961554  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3469  integrase family protein  41.97 
 
 
393 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00208728  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3698  integrase family protein  41.97 
 
 
393 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0843425  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  41.19 
 
 
393 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  41.19 
 
 
393 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  41.19 
 
 
393 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  41.19 
 
 
393 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  35.4 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  34.43 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  35.4 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  36.52 
 
 
323 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  35.39 
 
 
344 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  28.54 
 
 
373 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  34.92 
 
 
367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  28 
 
 
372 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  24.94 
 
 
361 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  33.73 
 
 
312 aa  126  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  25.19 
 
 
361 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  25.19 
 
 
361 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  25.19 
 
 
361 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  25.19 
 
 
361 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  25.19 
 
 
361 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  25.19 
 
 
361 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  25.19 
 
 
361 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  24.23 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  25.61 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  34.68 
 
 
519 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3970  phage integrase family protein  26.47 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1934  phage integrase  26.47 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3803  phage integrase family protein  26.47 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2053  phage integrase-like SAM-like  38.4 
 
 
141 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227287  normal  0.287411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  23.14 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  32 
 
 
374 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  32 
 
 
374 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  30.37 
 
 
400 aa  63.2  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  30.21 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  30.34 
 
 
324 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  34.73 
 
 
295 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  31.12 
 
 
285 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  29.91 
 
 
379 aa  59.7  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  32.12 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  30.05 
 
 
385 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  23.96 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0617  phage integrase family site specific recombinase  25.88 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000798153  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  31.15 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2172  phage integrase  24.94 
 
 
464 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.39744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  29.7 
 
 
403 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  26.14 
 
 
400 aa  57  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  25.87 
 
 
381 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  27.68 
 
 
324 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  32.43 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  26.34 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  29.62 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  31.15 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  31.82 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  26.26 
 
 
209 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.26 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  28.83 
 
 
363 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.95 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  30.9 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.04 
 
 
318 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.04 
 
 
318 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.04 
 
 
318 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  28.49 
 
 
305 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  25.44 
 
 
345 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.54 
 
 
345 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  29.34 
 
 
302 aa  54.3  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  25.28 
 
 
323 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 
353 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  31.51 
 
 
321 aa  53.9  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.44 
 
 
311 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  34 
 
 
409 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  34.64 
 
 
331 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  26.32 
 
 
322 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 
294 aa  53.5  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  29.79 
 
 
295 aa  53.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.24 
 
 
299 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  24.65 
 
 
300 aa  53.1  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  24.53 
 
 
364 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.77 
 
 
392 aa  53.1  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.07 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  31.43 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  29.05 
 
 
295 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  34.46 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  27.07 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.07 
 
 
300 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  31.96 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  29.35 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  24.27 
 
 
304 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.05 
 
 
300 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>