More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5279 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5279  amidohydrolase  100 
 
 
447 aa  907    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4377  guanine deaminase  59.25 
 
 
469 aa  525  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2966  amidohydrolase  59.76 
 
 
443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3607  guanine deaminase  42.38 
 
 
434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1677  guanine deaminase  38.85 
 
 
433 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3845  guanine deaminase  40.93 
 
 
434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.397164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4281  guanine deaminase  41.5 
 
 
434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523934  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1587  guanine deaminase  41.28 
 
 
434 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22260  guanine deaminase  40.98 
 
 
432 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.119985  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2754  guanine deaminase  38.62 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1794  guanine deaminase  38.53 
 
 
434 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44770  guanine deaminase  40.98 
 
 
434 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.828703  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3812  guanine deaminase  40.76 
 
 
434 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01787  hypothetical protein  37.72 
 
 
466 aa  263  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1148  amidohydrolase  39.29 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3663  guanine aminohydrolase  37.5 
 
 
437 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4872  guanine deaminase  39.07 
 
 
449 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.673098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1812  guanine deaminase  37.86 
 
 
444 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00974317  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2684  guanine deaminase  36.12 
 
 
441 aa  257  3e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0256  guanine deaminase  39.16 
 
 
439 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02716  guanine deaminase  35.98 
 
 
439 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02678  hypothetical protein  35.98 
 
 
439 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.600174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4173  guanine deaminase  35.76 
 
 
438 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0809  guanine deaminase  35.76 
 
 
438 aa  247  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3209  guanine deaminase  35.76 
 
 
438 aa  247  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0825  guanine deaminase  35.76 
 
 
438 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3016  guanine deaminase  35.76 
 
 
438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3717  guanine deaminase  38.79 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3043  guanine deaminase  35.54 
 
 
438 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1336  guanine deaminase  38.88 
 
 
435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521939  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2299  guanine deaminase  36.58 
 
 
443 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1143  guanine deaminase  37.02 
 
 
428 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14597  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2429  guanine deaminase  34.69 
 
 
431 aa  239  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2606  guanine deaminase  39.64 
 
 
444 aa  237  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3192  guanine deaminase  36.96 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.673626  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0081  amidohydrolase  36.26 
 
 
513 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1795  guanine deaminase  36.75 
 
 
432 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319049  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4129  guanine deaminase  36.48 
 
 
438 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2377  guanine deaminase  36.48 
 
 
439 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0977  guanine deaminase  36.28 
 
 
439 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0414452 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1807  guanine deaminase  36.3 
 
 
446 aa  226  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0539  guanine deaminase  36.28 
 
 
439 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1018  guanine deaminase  36.28 
 
 
439 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0893  guanine deaminase  36.62 
 
 
438 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0756096  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3045  guanine deaminase  34.88 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206823  normal  0.141945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0946  guanine deaminase  34.58 
 
 
451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334638  normal  0.424226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0210  guanine deaminase  35.77 
 
 
432 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1462  guanine deaminase  37.25 
 
 
430 aa  216  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0429597  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0889  guanine deaminase  35.78 
 
 
446 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159977  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01660  guanine deaminase  36.5 
 
 
456 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000118805  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0709  guanine deaminase  35.46 
 
 
441 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0506  guanine deaminase  35.91 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2429  guanine deaminase  35.2 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0881  guanine deaminase  36.84 
 
 
438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1926  guanine deaminase  34 
 
 
444 aa  212  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0907648  normal  0.0757179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2250  guanine deaminase  34 
 
 
444 aa  212  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4625  guanine deaminase  35.45 
 
 
447 aa  212  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0456  guanine deaminase  37.2 
 
 
434 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1727  guanine deaminase  36.21 
 
 
452 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434119  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3326  guanine deaminase  33.78 
 
 
435 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1087  guanine deaminase  35.38 
 
 
457 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0146521 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0370  guanine deaminase  36.77 
 
 
434 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2046  guanine deaminase  36.21 
 
 
452 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177828  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_004310  BR0354  guanine deaminase  36.77 
 
 
434 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1610  guanine deaminase  36.87 
 
 
437 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3479  guanine deaminase  34.75 
 
 
461 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0293  guanine deaminase  33.26 
 
 
426 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1896  guanine deaminase  34.52 
 
 
433 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0545  guanine deaminase  34.52 
 
 
428 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2099  guanine deaminase  34.67 
 
 
445 aa  203  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.716358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02520  guanine deaminase  34.3 
 
 
435 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4260  guanine deaminase  35.38 
 
 
425 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910106  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3142  guanine deaminase  32.43 
 
 
436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14624  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3881  guanine deaminase  34.87 
 
 
428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4494  guanine deaminase  33.89 
 
 
435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638874  normal  0.0636141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2870  guanine deaminase  32.21 
 
 
435 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5972  guanine deaminase  34.01 
 
 
419 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1905  guanine deaminase  33.82 
 
 
429 aa  196  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0463  guanine deaminase  36.47 
 
 
436 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.451458  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3023  guanine deaminase  35.94 
 
 
436 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0166  guanine deaminase  36.47 
 
 
436 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301231  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2609  guanine deaminase  36.47 
 
 
436 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.694405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2918  guanine deaminase  36.47 
 
 
436 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2978  guanine deaminase  36.47 
 
 
436 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528772  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0981  guanine deaminase  36.47 
 
 
436 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2771  guanine deaminase  33.5 
 
 
428 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.888774  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1496  guanine deaminase  31.21 
 
 
449 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3295  guanine deaminase  32.36 
 
 
445 aa  188  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403629  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2147  guanine deaminase  35.37 
 
 
454 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2724  guanine deaminase  31.98 
 
 
425 aa  186  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1468  guanine deaminase  32.47 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00567224  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1047  guanine deaminase  31.72 
 
 
430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134811  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4655  guanine deaminase  31.93 
 
 
457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0274988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2838  guanine deaminase  32.28 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1049  guanine deaminase  34.55 
 
 
427 aa  182  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1129  guanine deaminase  34.55 
 
 
427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.387393  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2623  guanine deaminase  32.44 
 
 
454 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1786  guanine deaminase  34.52 
 
 
453 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3458  guanine deaminase  34.93 
 
 
434 aa  179  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1336  guanine deaminase  32.92 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117257  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>