17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5212 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5212  LpqN  100 
 
 
245 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.14833  normal  0.148833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4282  LpqN  53.89 
 
 
233 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4368  LpqN  53.89 
 
 
233 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4661  LpqN  53.71 
 
 
233 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4816  LpqN  50.86 
 
 
229 aa  158  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.412903  normal  0.84725 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10594  lipoprotein lpqN  48.57 
 
 
228 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.543099  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1917  hypothetical protein  48.54 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4697  protein kinase  40.11 
 
 
587 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4403  protein kinase  40.11 
 
 
587 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4317  serine/threonine protein kinase  40.11 
 
 
587 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1366  LpqN  34.7 
 
 
238 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0852  hypothetical protein  28.24 
 
 
327 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0559953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6055  hypothetical protein  28.24 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5479  hypothetical protein  25.95 
 
 
297 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.846329  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5390  hypothetical protein  25.95 
 
 
297 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5766  hypothetical protein  25.95 
 
 
297 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555782  normal  0.844624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10039  secreted proline rich protein mtc28 (proline rich 28 kDa antigen)  23.93 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.768071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>