More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5030 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
885 aa  1755    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  72.6 
 
 
934 aa  1208    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1110  glycoside hydrolase family protein  36.27 
 
 
517 aa  314  5.999999999999999e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1675  glycoside hydrolase family protein  37.15 
 
 
513 aa  295  3e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.256832  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0408  glycoside hydrolase family protein  32.75 
 
 
489 aa  248  3e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0125143  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  34.27 
 
 
467 aa  244  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000340299  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  32.23 
 
 
486 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000739457  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  32.12 
 
 
436 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  28.6 
 
 
418 aa  189  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 
431 aa  167  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 
431 aa  166  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
442 aa  162  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  30.8 
 
 
445 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  30.11 
 
 
472 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  27.5 
 
 
432 aa  158  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 
399 aa  153  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  26.33 
 
 
443 aa  149  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  27.31 
 
 
417 aa  147  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  29.41 
 
 
453 aa  147  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  28.76 
 
 
450 aa  145  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  26.42 
 
 
446 aa  144  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  27.97 
 
 
452 aa  144  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  28.57 
 
 
453 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  31.45 
 
 
436 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  25.1 
 
 
468 aa  140  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  28.81 
 
 
453 aa  140  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  27.87 
 
 
448 aa  140  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  28.74 
 
 
482 aa  140  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  28.37 
 
 
447 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  26.89 
 
 
468 aa  138  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  29.32 
 
 
478 aa  138  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  26.34 
 
 
474 aa  137  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  26.55 
 
 
452 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  26.6 
 
 
470 aa  135  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  30.31 
 
 
455 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  28.9 
 
 
444 aa  135  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  27.44 
 
 
443 aa  134  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  29.61 
 
 
458 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  28.29 
 
 
484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  29.79 
 
 
462 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  24.07 
 
 
427 aa  132  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  27.29 
 
 
446 aa  132  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  28.65 
 
 
482 aa  131  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  29.16 
 
 
437 aa  131  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  24.7 
 
 
462 aa  130  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  25 
 
 
465 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  28.69 
 
 
486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  28.68 
 
 
491 aa  130  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  27.57 
 
 
472 aa  129  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  25.48 
 
 
470 aa  128  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  25.48 
 
 
470 aa  128  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  25.73 
 
 
439 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  29.09 
 
 
467 aa  128  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  29.39 
 
 
463 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  25.15 
 
 
460 aa  128  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  29.41 
 
 
467 aa  127  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  25.15 
 
 
460 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  25 
 
 
460 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  28.02 
 
 
494 aa  127  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  26.49 
 
 
463 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  29.32 
 
 
453 aa  127  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  28.75 
 
 
478 aa  127  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  25.15 
 
 
460 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  25.75 
 
 
451 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  26.49 
 
 
451 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  26.03 
 
 
478 aa  126  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  26.27 
 
 
451 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 
437 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 
411 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  29.35 
 
 
459 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  25.15 
 
 
467 aa  125  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  28.18 
 
 
456 aa  125  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  27.72 
 
 
494 aa  125  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  26.39 
 
 
447 aa  125  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  24.95 
 
 
460 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  28.54 
 
 
478 aa  125  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  26.49 
 
 
451 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  28.46 
 
 
489 aa  125  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  27.71 
 
 
479 aa  124  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  27.27 
 
 
458 aa  124  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  26.72 
 
 
446 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  28.16 
 
 
450 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  30.45 
 
 
466 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  28.75 
 
 
443 aa  123  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 
427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  26.67 
 
 
500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  25.68 
 
 
478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  29.8 
 
 
419 aa  123  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  26.49 
 
 
451 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  29.89 
 
 
517 aa  123  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  26.52 
 
 
446 aa  122  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  28.46 
 
 
457 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  26.73 
 
 
470 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  27.85 
 
 
485 aa  121  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  28.43 
 
 
479 aa  121  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  26.92 
 
 
452 aa  121  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  25.45 
 
 
452 aa  121  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  26.25 
 
 
463 aa  121  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 
439 aa  120  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  27.77 
 
 
457 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>