More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5002 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  63.74 
 
 		 937 aa  1009    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  63.74 
 
 		 937 aa  1009    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  63.69 
 
 		 930 aa  1030    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 940 aa  1829    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  63.41 
 
 		 937 aa  1003    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  49.13 
 
 		 929 aa  633  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  48.34 
 
 		 918 aa  614  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  47.72 
 
 		 928 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  48.16 
 
 		 903 aa  598  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  47.49 
 
 		 905 aa  583  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  45.89 
 
 		 936 aa  585  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  46.06 
 
 		 919 aa  575  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  44.94 
 
 		 923 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 950 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  40.39 
 
 		 925 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 894 aa  469  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 911 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  37.3 
 
 		 919 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 927 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  34.35 
 
 		 928 aa  362  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  37.02 
 
 		 884 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  36.27 
 
 		 909 aa  351  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 		 928 aa  350  5e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 927 aa  345  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  37.51 
 
 		 904 aa  319  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  37.05 
 
 		 913 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  37.02 
 
 		 938 aa  286  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  36.21 
 
 		 892 aa  278  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  33.44 
 
 		 940 aa  272  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 946 aa  270  8.999999999999999e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  35.23 
 
 		 910 aa  269  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  34.63 
 
 		 879 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  34.28 
 
 		 913 aa  255  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  30.49 
 
 		 917 aa  250  7e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  41.63 
 
 		 913 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  46.7 
 
 		 884 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  30.9 
 
 		 995 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.09 
 
 		 923 aa  212  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 923 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  51.36 
 
 		 240 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  38.51 
 
 		 955 aa  197  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 889 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  35.8 
 
 		 961 aa  169  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  35.96 
 
 		 923 aa  161  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  39.38 
 
 		 1064 aa  157  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  33.42 
 
 		 900 aa  124  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 1000 aa  121  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  30.07 
 
 		 927 aa  120  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  37.55 
 
 		 915 aa  120  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  38.93 
 
 		 916 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 919 aa  115  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  32.33 
 
 		 919 aa  115  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  32.33 
 
 		 919 aa  115  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  32.97 
 
 		 929 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  35.19 
 
 		 920 aa  109  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  39 
 
 		 934 aa  104  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  34.47 
 
 		 921 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  36.33 
 
 		 953 aa  94.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  42.04 
 
 		 974 aa  93.6  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 		 835 aa  93.2  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  38.22 
 
 		 893 aa  92.8  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  38.62 
 
 		 894 aa  92  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 929 aa  87.4  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  36.88 
 
 		 998 aa  85.5  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 959 aa  85.5  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  30.58 
 
 		 953 aa  84.7  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  34.57 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 910 aa  84  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  25.57 
 
 		 897 aa  83.2  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  30.46 
 
 		 997 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  30.62 
 
 		 921 aa  82.4  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 921 aa  81.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  30.35 
 
 		 921 aa  81.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  30.69 
 
 		 922 aa  80.9  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  30.03 
 
 		 940 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  39.55 
 
 		 946 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  29.23 
 
 		 998 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 877 aa  77  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  36.2 
 
 		 951 aa  77  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  30.74 
 
 		 914 aa  73.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  44.9 
 
 		 948 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  39.38 
 
 		 952 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 1015 aa  72  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  34.39 
 
 		 932 aa  72  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 		 960 aa  71.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.81 
 
 		 1150 aa  70.5  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  38.79 
 
 		 977 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1270  LuxR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582862 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  26.82 
 
 		 1133 aa  69.7  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 236 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.78 
 
 		 981 aa  68.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  28.67 
 
 		 1198 aa  67  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 		 947 aa  67.4  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 1137 aa  67.8  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 1085 aa  67  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  29.23 
 
 		 1029 aa  65.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  40.45 
 
 		 862 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  31.41 
 
 		 1052 aa  65.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  29.9 
 
 		 907 aa  65.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 1141 aa  65.1  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>