More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4916 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
309 aa  600  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  83.12 
 
 
309 aa  482  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  71.43 
 
 
317 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  70.96 
 
 
317 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  70.96 
 
 
317 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  49.01 
 
 
346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  47.99 
 
 
316 aa  245  6e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  49.32 
 
 
317 aa  245  6e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  48.65 
 
 
303 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  46.96 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  46.67 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  46.62 
 
 
303 aa  230  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  45.51 
 
 
335 aa  228  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  45.34 
 
 
332 aa  219  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  43.05 
 
 
329 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  45.36 
 
 
316 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  41.61 
 
 
317 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  43.79 
 
 
310 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  42.38 
 
 
306 aa  202  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  44.67 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  42.72 
 
 
316 aa  199  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  41.75 
 
 
326 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  40.25 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  42.14 
 
 
333 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  42.12 
 
 
306 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  40.66 
 
 
320 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  39.48 
 
 
321 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  38.49 
 
 
306 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  37.09 
 
 
306 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  38.11 
 
 
326 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  39.41 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  36.84 
 
 
306 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  31.02 
 
 
315 aa  146  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  37.17 
 
 
322 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  34.21 
 
 
308 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7036  fructokinase  45.63 
 
 
251 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  34.21 
 
 
308 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  38.43 
 
 
311 aa  142  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  35.28 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  34.54 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  31.61 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  35.53 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  35.5 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  35.6 
 
 
312 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  35.2 
 
 
306 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  35.28 
 
 
312 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  35.53 
 
 
308 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  35.2 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  35.2 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  35.28 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  33.88 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  37.93 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  39.53 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  34.42 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  33.76 
 
 
308 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  34.54 
 
 
306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  35.39 
 
 
321 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  36.48 
 
 
314 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  36.33 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  35.28 
 
 
310 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  35.6 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  35.58 
 
 
317 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 
322 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  35.08 
 
 
312 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  37.41 
 
 
313 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  33.78 
 
 
306 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  35.18 
 
 
319 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  34.44 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  35.67 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  34.19 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  37.38 
 
 
315 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.04 
 
 
323 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  32.89 
 
 
307 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  34.97 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  32.25 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  32.95 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  33.09 
 
 
304 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  30.1 
 
 
306 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.8 
 
 
307 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 
317 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  32.72 
 
 
304 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.06 
 
 
322 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  29.77 
 
 
319 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  29.77 
 
 
319 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  32.79 
 
 
319 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.15 
 
 
323 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  33.96 
 
 
320 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  28.06 
 
 
319 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  34.11 
 
 
298 aa  99.8  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl514  fructokinase  25.49 
 
 
306 aa  99.4  7e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.13 
 
 
313 aa  99  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.13 
 
 
313 aa  99  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.13 
 
 
313 aa  99  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  28.57 
 
 
320 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  27.85 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  31.44 
 
 
323 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  29.96 
 
 
308 aa  96.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  27.85 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  26.62 
 
 
314 aa  95.9  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>