More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4871 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  100 
 
 
348 aa  704    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  84.05 
 
 
351 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  66.48 
 
 
360 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  66.2 
 
 
360 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  66.2 
 
 
360 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  49.28 
 
 
334 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  47.9 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  47.9 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  48.18 
 
 
340 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  46.28 
 
 
339 aa  258  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  47.62 
 
 
339 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  49.71 
 
 
332 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  45.7 
 
 
288 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  61.11 
 
 
235 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  59.02 
 
 
751 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  59.68 
 
 
727 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  59.68 
 
 
727 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  59.83 
 
 
754 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  55.28 
 
 
590 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  56.56 
 
 
326 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  61.67 
 
 
195 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  45.73 
 
 
224 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  51.9 
 
 
198 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  51.27 
 
 
198 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  52.85 
 
 
824 aa  143  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  38.97 
 
 
358 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  52.34 
 
 
406 aa  139  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  40.54 
 
 
245 aa  139  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  56.91 
 
 
511 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  50.39 
 
 
340 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  58.33 
 
 
788 aa  136  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  45.81 
 
 
346 aa  135  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  52.59 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  39.92 
 
 
251 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  51.91 
 
 
458 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  47.37 
 
 
272 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  53.08 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  50.83 
 
 
348 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  51.72 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  55.2 
 
 
271 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  38.89 
 
 
452 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  48.06 
 
 
199 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  48.8 
 
 
360 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  48.41 
 
 
491 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  50.36 
 
 
383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  43.62 
 
 
236 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  52.07 
 
 
311 aa  119  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  49.61 
 
 
375 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  44.83 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  50.38 
 
 
446 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  53.45 
 
 
443 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  34.67 
 
 
269 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  52.89 
 
 
311 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  52.89 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  53.33 
 
 
294 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  47.33 
 
 
447 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  47.33 
 
 
447 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  53.33 
 
 
291 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  52.5 
 
 
292 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  42.38 
 
 
376 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  48.48 
 
 
284 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  52.94 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  44.12 
 
 
231 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  32.2 
 
 
482 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  53.98 
 
 
321 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  50.81 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  49.18 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  48.8 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  38.64 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.34 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  48.33 
 
 
582 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  51.77 
 
 
378 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  50.85 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  49.59 
 
 
243 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  42.58 
 
 
300 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  49.59 
 
 
238 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  49.58 
 
 
333 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  44.74 
 
 
541 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  41.52 
 
 
270 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  48 
 
 
238 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  50.86 
 
 
442 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  45.3 
 
 
468 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  34.02 
 
 
321 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  47.24 
 
 
442 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  48.74 
 
 
445 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  45.19 
 
 
318 aa  106  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  46.4 
 
 
398 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  43.42 
 
 
230 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  43.24 
 
 
247 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  47.97 
 
 
375 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  36.59 
 
 
282 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  40.24 
 
 
241 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  44.68 
 
 
387 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  48.7 
 
 
524 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.97 
 
 
298 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  38.62 
 
 
340 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  42.06 
 
 
404 aa  103  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  47.79 
 
 
314 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  44.53 
 
 
266 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  49.6 
 
 
284 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>