52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4726 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  100 
 
 
526 aa  1051    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  37.34 
 
 
517 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  38.89 
 
 
517 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  40.74 
 
 
533 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  36.83 
 
 
517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  36.83 
 
 
517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  36.84 
 
 
499 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  46.36 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  46.36 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  30.47 
 
 
540 aa  143  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  36.09 
 
 
580 aa  143  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  35.06 
 
 
528 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  35.76 
 
 
468 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  32.92 
 
 
502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  33.22 
 
 
588 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  35.21 
 
 
655 aa  125  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  32.52 
 
 
533 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  34.85 
 
 
427 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  37.63 
 
 
433 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  29.96 
 
 
494 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  34.95 
 
 
458 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  29.32 
 
 
542 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  29.32 
 
 
542 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  29.32 
 
 
542 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  28.16 
 
 
307 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  28.16 
 
 
307 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  28.16 
 
 
307 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  32.96 
 
 
783 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  30.08 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  30.08 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  30.08 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  28.87 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  25.19 
 
 
529 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  25.19 
 
 
529 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  25.19 
 
 
527 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  30.94 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  31.35 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
469 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  29.74 
 
 
401 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  31.07 
 
 
768 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  25.52 
 
 
448 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  34.33 
 
 
401 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  25.56 
 
 
518 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  27.24 
 
 
409 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  26.59 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  30.9 
 
 
898 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  30.97 
 
 
479 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  27.98 
 
 
410 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  28.33 
 
 
432 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  25.53 
 
 
431 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  27.27 
 
 
435 aa  47  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  24.6 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>