More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4609 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  84.35 
 
 
290 aa  509  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  77.16 
 
 
312 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  77.16 
 
 
312 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  77.16 
 
 
312 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  64.63 
 
 
302 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  48.33 
 
 
303 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  48.33 
 
 
303 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  48.33 
 
 
303 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  43.36 
 
 
293 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  43.49 
 
 
285 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
299 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  45.63 
 
 
280 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  44.03 
 
 
292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  42.41 
 
 
295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 
286 aa  218  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  43.3 
 
 
291 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  44.72 
 
 
300 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  44.1 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  42.9 
 
 
296 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  45.63 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  40.86 
 
 
289 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  37.92 
 
 
301 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  42.69 
 
 
285 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  40.69 
 
 
305 aa  198  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  41.27 
 
 
290 aa  195  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 
294 aa  193  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  41.11 
 
 
272 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  38.8 
 
 
302 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  34.84 
 
 
303 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
326 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  27.95 
 
 
408 aa  89.7  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
311 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
298 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  30.83 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  26.62 
 
 
607 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  30.86 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  30.42 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  26.37 
 
 
290 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  27.95 
 
 
626 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  32.94 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  25.98 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.15 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  27.72 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.67 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
255 aa  67  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  24.36 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  27.59 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  26.19 
 
 
265 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  31.55 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  27.14 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  23.05 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  27.56 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>